然而，尹继善的成功并非没有波折。雍正十年（1732年）冬天，尹继善因调任云贵总督入觐，雍正帝询问其母亲是否受到封赏。尹继善欲奏请封赏其生母徐氏，但被雍正帝打断，表示将亲自下达旨意。然而，这一举动却引发了尹泰的不满，他认为尹继善未经其同意便向皇帝请封生母，是以下犯上之举。尹泰愤怒之下，甚至动手打了尹继善。
雍正帝得知此事后，立即派遣宫中人员前往尹泰家中，为尹继善及其生母徐氏打抱不平。第二天，宫中派来四名宫女和四名内监，为徐氏梳妆打扮，并册封她为一品夫人。雍正帝的旨意明确指出，尹泰能够入相，全赖尹继善的贤能，而尹继善能有今日，也离不开其生母徐氏的养育之恩。这一幕不仅体现了雍正帝对尹继善的特殊恩宠，也展示了他对大臣家庭事务的干预力度。
雍正帝的这一举动，不仅彰显了他对尹继善的器重，也反映了他干预大臣私生活的独特方式。早在雍正三年（1725年），雍正帝就曾下令，如果大臣在家中有任何不便或受制于人的情况，可以秘密奏报，他将亲自处理。雍正帝对尹继善的特别关照，正是他这种执政风格的具体体现。
尹继善对此深感感激，上奏表达自己及家人对皇恩的无比感谢。雍正帝也不断告诫尹泰，要求他教导尹继善以公忠之心为国效力。尹继善与怡亲王允祥的关系也非常密切，允祥曾赐给他一件青狐裘以示宠荣。
此外，尹继善的婚姻也为他的人生增添了光彩。他的继室是大学士鄂尔泰的侄女，鄂夫人知书达理，与尹继善感情深厚，这段婚姻无疑为尹继善的仕途锦上添花。
二、八旗读书人
乾隆四十四年（1779），乾隆帝撰写了《怀旧诗》，将尹继善列为“五督臣”之一，并高度评价了他的政绩和品行。乾隆帝称尹继善为八旗读书人的楷模，称赞他“政事既明练，性情复温厚”，并指出他所到之处都能妥善处理事务，被赞誉为“福星”。这一评价充分体现了乾隆帝对尹继善的高度认可。