贞观四年（630年），侯君集在军事领域的表现获得了朝廷的高度认可，晋升为兵部尚书，这个职务在唐代主管全国军事行政事务，意味着侯君集已经从一名前线将领转型为国家军事政策制定的重要参与者，深度介入了唐朝的军事战略布局和军队建设工作。
贞观九年（635年），面对唐朝西部边境的威胁，吐谷浑频繁侵犯，唐太宗李世民决定予以坚决回击。侯君集有幸与一代名将李靖并肩作战，两人携手出征，凭借高超的战术部署和灵活多变的战略方针，成功平定了吐谷浑的侵扰，这一胜利不仅巩固了唐朝在西部地区的统治，还极大地提升了唐朝在周边民族中的威望，保障了丝绸之路上商旅的安全通行，对于促进东西方经济文化交流具有重大意义。
贞观十二年（638年），侯君集肩负起更加艰巨的任务，以交河道行军大总管的身份领军远征高昌国。此役中，侯君集充分展现了其运筹帷幄、决胜千里的军事指挥才能，经过精心筹备和有力推进，终于在次年（639年）攻克了高昌国，使得唐朝直接掌控了这片位于西域的战略要地。这次征服拓展了唐朝的疆域，强化了中央政府对西域诸国的影响力，对于维护丝路沿线的安定和繁荣具有里程碑式的意义。
由于侯君集在这几次重大军事行动中的出色表现和卓越贡献，他的名声传遍天下，赢得了广泛的赞誉和朝廷的高度嘉奖。贞观年间，唐太宗为了表彰他的功绩，特别对其封爵进行提升，改封侯君集为陈国公
四、文武双全，仕途高峰与转折
侯君集在唐朝前期的确是一位兼具军事才华与文化素养的复合型人才。他在战场上的战绩彪炳，不仅在对外战争中建立了赫赫战功，如平定吐谷浑、远征高昌等，充分展示了他卓越的军事指挥才能和决胜千里的胆略。然而，随着时间的推移，侯君集开始意识到知识和文化修养的重要性，尤其在晚年，他开始发奋读书，追求内在的精神世界充实，这种与时俱进的学习态度，使他在众多将领中独树一帜，展现出难得的文化自觉。
除了在军事领域的卓越成就外，侯君集还在仕途上表现出行政管理的才能。他曾被委任为吏部尚书，这是一个负责选拔官吏、考核官员的重要职位，表明他在人事管理方面的能力得到了朝廷的认可。在该职位上，侯君集积极参与朝政决策，为唐朝初期的政治稳定和吏治清明做出了贡献。
然而，侯君集的仕途并非坦途，他也曾因个人品行问题遭受挫折。据史书记载，侯君集因贪图财宝而一度被捕入狱，这反映出他在追求功名利禄的过程中迷失了自我，触犯了律法。虽然侯君集后来获释，但此事给他带来了极大的心理阴影，一方面可能让他对朝廷产生了怀疑或不满，另一方面也可能加剧了他内心对权力和财富的渴望，这些因素都为他后来卷入宫廷阴谋，乃至走上背叛之路埋下了隐患。