与此同时，孛罗帖木儿与另一位重量级军阀扩廓帖木儿（王保保）之间的矛盾逐渐升级，成为了元末政治舞台上的一出重头戏。这不仅仅是两个军事强人对土地和资源的争夺，更深层次的是对元朝未来走向的影响力之争。山西，作为连接南北、东西的战略要地，自然成为了双方争夺的焦点。对孛罗帖木儿而言，控制山西不仅能巩固自己在北方的军事优势，也是向南扩张势力范围的关键一步；而对扩廓帖木儿来说，保持对山西的控制，则是保障其在中原地区影响力和战略纵深的必要条件。
两人的争斗，不仅仅是战场上的直接对抗，更多体现在政治手腕和外交策略的运用上。孛罗帖木儿利用其在中央的影响力，争取朝廷的支持和资源倾斜；而扩廓帖木儿则凭借其在中原地区的广泛影响力和强大的军事实力，构建了自己的联盟网络。这场斗争背后，是双方不断调整策略，争取地方势力支持，以及在元廷内部进行激烈游说的过程。
三、清君侧：一场以正义为名的军事行动
至正二十三年，孛罗帖木儿因卷入皇室内斗，藏匿皇太子爱猷识理达腊的政治对手老的沙等人，遭到了皇帝的严厉惩罚，被削去了官职。这一事件表面上看是孛罗帖木儿的一次重大挫折，实则为其后续的政治行动埋下了伏笔。不甘屈服的他，选择了一条更为激进的道路，那就是以“清君侧”为名，公开挑战皇太子一派，意图通过军事手段来干预朝政，恢复自己的地位，同时表达对元朝现状的不满和改革的决心。
“清君侧”，在中国古代历史上常被用作起兵反抗的正当理由，指清除皇帝身边的奸佞小人，以恢复朝纲。孛罗帖木儿借此口号，集合麾下的军队，对元朝的首都大都发起了猛烈的攻击。这次行动不仅是一次军事冒险，更是一场政治赌博。令人意想不到的是，这次突袭竟然取得了成功，迫使顺帝不得不妥协，交出了太子一党的两名关键人物朴不花和搠思监，二人随后被处决。这一胜利不仅让孛罗帖木儿重新回到了权力中心，还让他暂时掌握了朝政大权。
掌握实权后的孛罗帖木儿，立即着手实施一系列旨在挽救元朝颓势的改革措施。他深知元朝末年面临的诸多问题，如宦官干政、财政亏空、宗教势力膨胀等，这些问题严重侵蚀了国家根基。因此，他首先对宫中的宦官势力进行了大力整顿，削减其权势，减少其对朝政的干扰；同时，采取紧缩政策，力求节省不必要的开支，缓解国家财政的紧张状况；另外，针对西番僧人过度的佛事活动及其背后的政治经济特权，他也进行了限制，以减少国家资源的无谓消耗，试图恢复社会秩序和国家财政的健康。