在思金和机械教交战时，凯恩回归并在Nod大神殿旧址引爆了一发泰伯利亚导弹，数千万人丧生在爆炸中，同时还导致了泰伯利亚剧烈扩散。按理说这种程度的晶流爆炸已经足够让思金以为这是泰伯利亚成熟的征兆并赶来收割，但现在思金和机械教拼得你死我活，哪里有时间来管这偏远地区的泰伯利亚成熟？凯恩的所作所为只是吸引了一波新的围剿，旧Nod残部死伤惨重，凯恩在大神殿中被离子炮命中，生死不明。
此后GDI与地狱的同盟关系一直持续，Nod又发起了几次反抗，但都被镇压下去，GDI在保证军费充足的同时制造了大量泰伯利亚清理设备，几个黄区被复垦成蓝区。GDI不想依赖泰伯利亚武器，因此几乎完全没有研发，但地狱不会管这么多，大量泰伯利亚武器被研究出来，地狱还将泰伯利亚移植到他们世界的几个矿物星球上，增加泰伯利亚的产量。由于低温和没有大气层，泰伯利亚生长缓慢。
他们开始研究泰伯利亚催化剂，从Nod的遗产中拼凑出他们曾经的计划，拼凑出曾经那个全球泰矿化的美好蓝图。有Nod曾经打下的基础，再加上GDI在大神殿废墟中找到了塔西佗，对泰伯利亚的研究非常顺利，催化剂效果良好，即使是在一颗近地轨道的陨石上，泰伯利亚也可以以最快速度生长。
新黑手军团作为联合精英军团建立，这个军团由GDI的实验级装甲部队、泰伯利亚炎魔部队和圣徒部队组成。泰伯利亚炎魔在经过训练后被给予了更强的装甲，装甲上装备了可以自己装填弹药的制导火箭，弥补了对空的不足。圣徒小队装备有以泰伯利亚为弹药的离子冲锋枪，无论对步兵还是装甲都有杀伤力，他们是黑手的主要士兵。GDI实验级装甲部队装备GDI最新的载具研究成果，包括且不限于六足狼獾和泰坦机甲、四足神像机甲、猛犸悬浮坦克、会广播光明魔法的净化者机甲等。
在GDI完成全球泰伯利亚清理后不久，机械教结束了和思金的战争，思金人战败，整个族群分散到全宇宙有泰伯利亚的星球上。机械教追击思金的时候经过了GDI和地狱的星球，在确认身份后，卡贝勒斯有一瞬间想让这颗星球上的所有人全部撤离。他的实力虽然勉强可以和欧姆弥赛亚对抗，但他手下的军队绝不是机械教的对手。所幸机械教没有占领这里的打算，机械教在这里建立大使馆，算是机械教和地狱领的窗口。