在帝国的快速绞杀之下，第二大陆军很快就失败了，大量的高层人员被逮捕和屠杀，仅仅有大约2万多人在林肯的带领下从纽约突围出去，向着西方进发。
然而帝国政府仅仅是将林肯所带领的第二大陆军赶到路易斯安纳州之外的领地便放弃了继续追击。
毕竟越往内陆走帝国军队的后勤补给也就越困难，消耗的财力是巨大的。
而且大英帝国也不认为这2万人能够掀起什么风浪，所以便放弃了继续向西追击。
不过林肯所带领的第二大陆军并没有因为失败而解散，反而这支队伍在这一系列的困难中得到了锻炼，变得更加坚强。
林肯实际上在纽约起义失败后消沉了一段时间，因为在这次失败中，他失去了70%的战友以及自己的亲人，原先有着十几万的第二大陆军也仅仅剩余了2万余人。
而且最让林肯受到打击的是，他预想中殖民地人民踊跃投身起义的事情并没有发生，殖民地的人民在起义发生时对于起义完全持漠视的态度。
有些人甚至对第二大陆军进行谩骂，说他们为什么要干掉那些英国来的老爷，如果没有老爷他们去哪里干活，怎么样才能生存下去？
而且林肯在纽约起义成功后也遇到了罗伯特比尔在巴黎公社成立之后的问题，那就是参与革命的人实际上素质参差不齐，所以他们在起义成功后很快就开始腐化。
第二大陆军能如此之快的被帝国镇压离不开革命队伍中那些叛徒的帮助。
不过在消沉了一段时间后，林肯又重新振作了起来，因为他收到了一个消息，那就是第2次法兰西无产阶级革命终于在1842年成功了。
法兰西公社吸取了巴黎公社失败的教训，在马克思的带领下经过长达6年的武装斗争后，战胜了法兰西共和国，于巴黎成立了法兰西公社。
法兰西公社的成功大大激励了林肯，自此之后，林肯开始关注起了法兰西公社的一切，想要从中找到革命成功的办法。
而在这个时候第二大陆军的残部也行进到了路易斯安那州的附近。
在这里，林肯的第二大陆军遇到了一些特殊人士，这里的村民向大陆军传授了社会主义共产主义思想，并向他们分享了部分农耕技术和军事战术。
林肯的大脑也在这段时间进行了升级，如果说在此之前，林肯仍然是一位代表小资产阶级利益的资产阶级改良家的话，到了现在，林肯已经大脑升级成了一位社会主义革命家。
所以林肯在这些人的帮助下，于密西西比河的一处三湾处重整了第二大陆军，并按照法兰西公社的组织架构重整了整支部队，确立了整支部队的指导思想。
然后林肯遣散了部分队伍中的伤员以及一些不愿意继续革命的士兵后，带领着剩余1万左右的部队继续向西方进发。
在那里，林肯将要带领这些仍然信任他的人们建立起一个远离专制与压迫的乌托邦。
而这也是第二大陆军最后一次在军情处档案中的记录。