透过查克拉在体内的流转与汇聚，也可以产生许多截然不同的增幅，比如强化抗打击能力，比如增强移动能力和支持忍者在各种地形移动等等，作用极大。
也因为查克拉的作用太过于广泛，所以低等文明层次的忍者往往急于求成，而不断地压榨着自身潜力，造成了【忍者职业是短命职业】的事实。
忍者职业的三条发展路线也不是随随便便定下来的，是经由无尽岁月的摸索和积累，这才总结出来的系统化模式。
查克拉的本质，就某方面来说其实就是【伪气】、【伪三宝合一】，它缺了精气神三宝中的【气】，属于半成品、不完全体，走的是所谓的捷径。
为了更进一步，进而达到更高的层次，最有效的办法便是补足这个缺憾，使精气神三宝合一。
体术忍者的查克拉在提炼出来以后，基本上都用在细胞的蕴养和强化上面，凭借着训练来打磨肉身和意志，再经由药浴等方式来填补根基。随着肉身益发地强大，血气也就自然而然地壮大，当体术忍者的生命层次达到一定高度以后，这些血气就能在合理的范围里面被提炼成所谓的血气查克拉。
血气查克拉这个名词似乎有些陌生，可若说到【八门遁甲】这个体术禁忌，很多人便能搞懂这血气查克拉究竟是什么玩意儿。
忍术忍者的修行方式与体术忍者不同，他们的查克拉虽然也会拿来蕴养细胞，可是却不需要刻意地进行强化，蕴养的目的更多是为了维持细胞的活性并延缓它们的老化速度，强度什么的基本上是随着查克拉的提炼和蕴养做自然提升，所以最多只会消耗一半左右的查克拉。
剩下来的查克拉会在体内按照一定的规律不停地流转、循环，使身体细胞一直处于查克拉的覆盖的状态，哪怕没有多少蕴养的效果，但至少可以有效地维持细胞活化的状态。
不过，为重要的是在查克拉运转的过程中，可以不断地牵引着细胞本身自然而然散佚出来的身体能量，将之汇聚成一股，随着查克拉不断地在体内运转。
这股身体能量会随着精神能量的渲染和查克拉的影响，渐渐地改变性质，最终成为忍者职业所谓的内息查克拉。
至于幻术忍者的部份，则主攻脑部细胞的蕴养，使精神能量渐渐地蜕变，最后透过精神能量开启眼、耳、鼻、舌、身、意的特殊能力，形成一种有别于精神能量的独特查克拉，其中最先开启也最为着名的便是眼睛的力量，因此也被称之为瞳力查克拉。
藉由这三种衍生出来的查克拉进行融合，使自身的查克拉成为三宝合一的查克拉，这才是忍者职业之所以能够成为中等文明，个体甚至可以进入高等文明层次的根本。
只不过凭借着这种后天演化出来的查克拉，想要突破那道门槛晋阶史诗却十分地困难，远远不及利用自然能量形成仙术查克拉并构筑所谓的仙人体，以及利用异种查克拉所构筑的专属查克拉的忍者晋阶史诗的机率高，但却是二次元宇宙当前最为主流的修行方式。