考功司掌理文职官之处分、议叙，兼办封爵、世职、恩荫、难荫、请封、捐封等事宜；
文化司主管人文地理，宗教、名人祠之修建与弘扬；
吏教部尚书由内阁首辅谢安出任，且暂兼考功司司长之职，文翁续任教育司司长，卫生司司长则为原医疗司司长徐之才，文化司司长由东吴降臣黄庭坚担任。
②工商部，下设建设司、农业司以及商务司、商业司：
建设司统辖皇城建设与规划，此外各地城镇布局与建设规划，亦须先经建设司许可；
农业司司职全国土地开垦，兼及水利工程建设；
商务司监管国中货物价格，适时提出调整，以保物品价格在特定阈值内，并订立商业税收制度，收缴商业税。
产业司掌管所有国有企业；
工商部尚书由原商业司司长麋竺出任，并暂兼商务司、产业司司长之职；农业司司长由王安国继任，并暂兼建设司司长之职。
③军务部，下设兵役、军纪、军器及车驾四司：
兵役司掌理包括府兵在内的所有军籍，且负责从府兵中拣选精壮以补入正规军；
军纪司司职制定军队之规章，兼管武职官员的叙功、核过、抚恤、军旅之简阅、考察以及巡防诸事；
军器司主司生产兵器、甲胄、弓弩及战争器械；
车驾司承继原邮政司之职，在负责驿传、马厩牧事的同时，协助各部门向下方传递相关文书，服务军队向朝廷呈递战报，并为边防驻军与野战军寄送家书；
军务部尚书由原军籍司司长刘洎出任，并暂领兵役司、军纪司司长之职；车驾司仍由王悦执掌；军器司司长由原百工司司长崔弘丹担任，原武器作坊主事风胡子任军器司从事，为崔弘丹之佐。
风胡子由与司长等同的武器作坊主事，降为司长之属，看似降职，实则包括风胡子在内，全体工匠尽皆欣喜，盖因此举意味着他们真正迈入了乾国的官僚体系。
④民政部，下辖监察司、户籍司、律法司以及提刑司：