参观完空军的新装备并下达生产指令后，王耀离开了空军指挥中心。但他没有立即回宫，而是前往位于主基地群北边的一个科研基地。红警主基地群已从孟海镇迁移到大秦帝都西北的平原，而在其更北边，靠近巴彦山脉的山谷中，有一个重达三千吨的科研基地。这里由红警主基地群保卫，秦军士兵和军犬巡逻，周围有高墙、碉堡，甚至光棱塔。
王耀的车队通过正门进入科研基地，直奔基地深处。山体下有几个十几米高的巨大隧道，入口处的秦军士兵都是精锐，门口还有防御设施。经过层层士兵的检查，车队抵达隧道深处。这是一个位于巴彦山脉两千多米深处的巨大基地，红警分基地正在快速建设周边的工程。这是王耀为应对可能的核战争所做的准备。
这座基地的隧道出口长达五千米，山体最高处超过两千米。一旦爆发核战争，这座基地将成为王耀最后的避难所。巴彦山脉的阻挡使得核弹难以穿透基地，红警系统中的辐射工兵技术也能在核战后生产辐射工兵和相关防护设备。即使在核大战后，王耀也能依靠这个基地重建资源。
继续前行，一座外观类似作战实验室的建筑映入眼帘。王耀下车后，带着伊娃等人直奔实验室内部。在巨大的防护窗前，王耀停下脚步，走近防护窗，观察里面的景象。防护窗内，一位白发爆炸头、身材微驼的老人穿着白大褂，正忙碌于一台布满线圈和电弧的大型机器前。老人似乎察觉到了有人在注视，停下工作，缓缓转头，狂热的目光与王耀对视。“阿尔伯特·爱因斯坦！”王耀眯起眼睛，低声说出这个名字。