所以，他们选择了退让，好在太子朱常洛还是很听话的。
眼下，万历皇帝身体一天不如一天，只要朱常洛继位登基，他们一番嘴炮，不怕朱常洛不搁置朱由校。
朱由校又去找万历汇报情况，说了全部皇庄整顿的事情、燧发枪装备军队、三大营整顿完成、重新任用几大武将勋贵抢占兵部文官职位、重启矿税、皇庄工坊产量大增、流通税征收顺利等等。
万历听得不耐烦，问道：“你就直说，现在你有多少银子？”
朱由校：“连同各种税收和工坊售卖的收益，以及各种抄没的赃银，至少五千万两！
要不，都交给户部管理？”
万历忽然暴起，在朱由校头上狠狠敲了一下！
王皇后大惊：“皇上，这是做什么？敲傻了可如何是好！”
万历：“不用敲，已经傻了！
居然要把银子交给户部，那不是肉包子打狗吗？
那帮子文官，干啥啥不会，吃啥啥不够！
还是你管着，想怎么用就怎么用！”
朱由校大喜，说道：“孙子想去南京，整顿一下江南的政事，还要看一看江南的粮食、以及税收如何。”
万历：“你不怕累，就去干！爷爷支持你！给你尚方宝剑，还有兵符，想干谁就干谁！
当然，捅了篓子，爷爷可不管！”
朱由校跪下磕头，接过尚方宝剑和南京兵部的兵符，使劲挤出两滴眼泪：“爷爷，孙子会想你的！”
万历笑骂：“一时半会儿的，还死不了！这快过年了，也干不成什么大事，不如年后再去！”
朱由校：“听说东林党的高攀龙，整日品评政事，干涉朝政，朝中的官员很多与其同气连枝，这种风气，再不整顿，我朱家就在朝廷失声了！
天下没有了皇家的声音，百姓们什么都听东林党的，这么下去，可了不得！”
王皇后说道：“就是这个理！东林党太过猖狂，大孙子，你去收拾他们，让他们知道，这是谁家的天下！”
朱由校笑道：“奶奶，您身边的侍女，再给两个呗？”
王皇后：“臭小子，过年就十六了，可别学你爷爷、你爹，整出那么多事！
老老实实的，明年给你大婚，正经八百娶个媳妇！”
万历皇帝听得老脸一红：当年要不是他没憋住，整出个朱常洛，哪有后来几十年不上朝的荒唐事！
辞别了万历，朱由校带领定远侯邓文明、怀远侯常延龄，各自带领两千皇庄护卫军，以及整顿后的杨肇基升为神机营总兵官、副将麻时，带领一营火枪兵，随军同行。
作为朱由校最为倚仗的将领，张之极却没有跟随，他要和他爹负责北京城的防务，以及通州港的收税。
锦衣卫指挥使骆思恭当然也跟着。
南京是明初的都城，后来朱棣发动靖难之役，定都北京。
不知道朱棣出于何种考量，在南京还保留了一整套中央机构，与北京一般，设有完整的六部班子，还有都察院、通政司、五军都督府、翰林院、国子监等机构，官员的级别也和北京相同。
到了明朝中后期，南京的中央机构实际上已经成为养老机构，一般就是党争失败的官员，看似是平级调动到南京，实则是贬到了南京。