这时佛郎机炮船也来到了适合的位置，各船排开向陈友谅的水寨不断射出燃烧球。燃烧球一射中爆炸开，就是一片火海，不一会，陈友谅苦心制作的牛皮船，在机炮的攻击下显得不堪一击，因为一旦着火，火借风势，风助火威，就一发不可收拾地燃烧起来。不一会，水寨就全部被烧起来，大火熊熊，船上的人四处奔跑，人喊马叫，喊爹喊娘的声音不绝于耳。
郭兴、郭英见水寨起火，也就带上士兵到旱寨投燃烧弹，这一下水寨和旱寨全被烧起来了，陈友谅见势不好，忙带着妃子和年仅十岁的两个儿子，坐着快船逃出去。
陈友谅的六个兄弟都是骁勇异常的将领，可惜生不逢时，错跟其主，在鄱阳湖的第二次战争中就有三人被火烧死，二人被抢击死，除了陈普略，全部为国尽忠，葬身湖底。
陈友谅逃出水寨，回头望去，看着士兵在火中挣扎，呼天喊地，不禁泪流满面，心如刀绞地哭骂道：“这个该死的贼和尚，太狡猾了，你有本事就和我一刀一枪地拼嘛。怎么用这种下九流的手段，烧死这么多人！”
陈友谅哭一阵，又咬牙切齿地骂一阵，这时逃出来的越来越多，陈友谅忙把这些人收集在一起，重新把人组织起来，他趁天还未晚，清点了一下，人已不足十万，能作战的也不过五六万人，何况这些人都是惊弓之鸟，没有什么战斗力，船只现在只剩下快船和一些小船，大船已全部葬身火海。晚上，陈友谅随便在湖边的船上吃了些东西，凄凄惨惨地对付了一夜。第二天早上起来一看，他的左右二金吾也不见了。
原来左右二金吾见陈友谅战败，半夜里就带上自己所属部下共两万多人走了，加上其他开小差的，一夜就走了三万余人。
朱元璋在当天夜里追击陈友谅至罂子口，因天黑就驻扎左蠡，扼住长江上游。第二天早上见陈友谅的左右二金吾来降，朱元璋十分高兴，马上召见，安慰备至。原来二金吾一个主张作战，一个主张后退，都没有被采纳，知道跟陈友谅没有出路，就带上部下来投朱元璋。朱元璋问明情况后说道：“这么说来，陈友谅的六十万人经昨天一战，已经只有一成的兵力，我们再努力一下，彻底打垮陈友谅是没有问题的。”
陈友谅把剩下的士兵带到泊堵矶上面驻扎，指挥所就设在鞋山上。
昨天双方战斗都进行得很惨烈，陈友谅死伤约四十多万人，被俘和投降的约十多万人，朱元璋虽然取得了决定性的胜利，也付出了两万多人的代价。常言道：杀人一万，自损三千，战争的规律就是这样。在火烧战船的战斗中，朱元璋折损大将达三十六名，其中值得一提的是有水师的先锋船的栀杆被大风吹折，船桅又砸坏另一大船，两条大船被汉兵围住，先锋张志雄受伤后仍和汉兵苦斗，直到最后张志雄、余昶、陈弼、徐公辅、陈兆先、王胜、李信、姜润等全部战死，其中丁普郎身中十余刀，头被砍去，仍立在船上，两手举刀，僵立于船中，直至两只船被朱元璋的将士救出，只夺得尸骸而归。