神域联盟总部，位于神域与灵域中间星域内的一处恒星群之间。这一带一百光年范围内星域，恒星分布比较密集，大概有二十来颗恒星，而最近的两个恒星之间，距离只有不到一光年。神域联盟总部，就建立在距离相对较近的几个恒星之间。
神域联盟设有五道空间站传送门，它们分别通往五个地区。这五个地区，其中一个是灵域最近的昊天域星海界门，还有一个是刑域边缘区域，接近魔域的无极黑渊，还有一个就是云霄神庭恒星系外的信息空间站。至于最后的两个地区，分别是神河舰队指挥中心，以及神河星际空间站。同样的，这五个地方，在神域联盟也有对应的信号站。
这五个地方里，云霄神庭辉煌不在，已经成为过去，而昊天域的星海界门，则由那里最近的一个星球势力负责监管。
还有刑域边缘的无极黑渊，那里是魔域魔星势力与刑域之间的通道，此处由两域势力共同监管。至于神河舰队指挥中心，那里受神域联盟管辖，可以调配神河所有的战舟舰队，整个神河的星际防线都由他们负责。
最后还有神河星际空间站，它的传送门传送点有两个。最开始它只能传送到天河系内天极星域天启星外的空间信号站，后来经过重新改造，也可以传送到玄河系内神圣星域恒星系外的空间信号站。
另外，除了传送之外，神河星际空间站也负责监察整个神河的空间异常信号波动，而神罚一号城舰就负责守卫这里。
说到神罚系列城舰，他们是由天使帮忙设计和建造，在多个星域都有分布。后来神罚城舰与神河舰队互相配合，就构成了整个神河的星系防线。
神域联盟总部中心，建立在守望者号太空城舰之上。这守望号太空城舰，平均直径有一百公里，总部中心大殿位于正中央，而前后左右四个方位，分别是冥域，神域，灵域以及魔域代表中心大殿。
冥域在守望者号城舰上的代表，只有十二位暗影界大将。他们全部由重明尊主统领，其中有四位是女性。
神域在守望者号城舰上的代表，只有四位神庭战士，他们由元昊神王带领。
灵域在守望者号城舰上的代表，是九天域九大神国留在这里的长老。灵域九天域，每一域都有一个神国在名义上统辖各星。从距离神域最近的昊天域开始，那里大部分星球由永恒神国统辖，然后顺时针开始数，暗影神国统辖幽天域，风雪神国统辖玄天域，圣灵神国统辖变天域，无极神国统辖苍天域，烈阳神国统辖阳天域，凤凰神国统辖炎天域，星辰神国统辖朱天域，最后天元神国统辖钧天域。这九大神国，各在守望者号城舰上留下了两位长老和若干弟子，加起来一共有一百多人。