从此，西域地区正式列入了西汉王朝的版图。
汉宣帝嘉奖郑吉的功劳，下诏说：“都护西域骑都尉郑吉，镇抚外蛮，宣扬汉朝威信，迎接匈奴单于的堂兄日逐王民众，攻破车师国兜訾城，功绩卓着。封郑吉为安远侯，食邑千户。”郑吉在西域中部建立幕府，修建乌垒城，镇抚各国，诛伐抚慰他们，汉朝的号令在西域颁布，是从张骞开始，而由郑吉完成的。
郑吉卸任返回内地后，汉以其功绩封为安远侯，食邑千户，郑吉去世，赐谥号为缪侯。
郑吉，在西域都护府建立初期，为了对西域进行有效的管理，调解西域诸国之间的关系，做了大量的工作。在西域二十余年，以屯田渠犁、击破车师、迎降日逐王，出任西域都护而功绩卓着，永载史册。如《汉书》所论：“汉之号令班西域矣，始自张骞，而成于郑吉。”