李辅国权倾朝野，宰相及朝中大臣想见皇帝都须经过李辅国的安排，皇帝的诏书也需要李辅国的署名才能施行，群臣不敢提出不同意见。宗室贵人对李辅国也以“五郎”尊之，当时的宰相李揆更称李辅国为“五父”。
对于李辅国的不法行为，宗室李岘多次举报给唐肃宗，然而在李辅国的操纵下，唐肃宗却把李岘贬出了京城。一手遮天的李辅国企图做唐朝的第一位宦官宰相，此举遭到了宰相萧华的激烈反对。李辅国怀恨在心，多次在皇帝面前诬陷萧华，并威逼皇帝用自己的亲信元载取代了萧华的相位，最终将萧华逐出京城。
李辅国之所以为所欲为，还得益于与肃宗皇后张氏的勾结，张皇后与李辅国内外相应，控制政权，他们对不利于自己的人，无论是高官还是显贵都是除之而后快。唐肃宗的第三子建宁王李倓聪明过人，尽心辅佐太子广平王李豫，深得皇帝的欢心。然而由于张皇后与李辅国的中伤，以致最后皇帝下诏赐死了建宁王，李辅国与张皇后的狼狈为奸是为了各自的利益。
在肃宗病重期间，张皇后想要诛杀李辅国与程元振，唐玄宗病死，唐肃宗听说之后，病的更重了。张皇后为了便于自己将来继续插手政局，密谋准备杀掉唐肃宗所立的太子李豫，改立越王李系。张皇后与越王在宫中组织了有武勇者二百余人，此举被李辅国的同党发现，李辅国等首先把太子保护起来，然后逮捕了越王及其支持者，并囚禁了张皇后。当晚唐肃宗病死，第二天唐代宗李豫登基为帝。
自此李辅国日益骄横，曾对唐代宗说：“大家但内里坐，外事听老奴处置。”闻此僭君之言，唐代宗不快，决意将李辅国翦灭，于是唐代宗表面优待辅国，尊之为“尚父”，封司空兼中书令，却私下通联宦官程元振，以药子昂代元帅府行军司马，掌握禁军，夺兵权。罢辅国官职，进封为博陆郡王。不久，又派人于深夜将其刺杀，割下头颅扔到溷厕中，遂刻木代其首级以葬，赠太傅，谥号为丑。