因为此次事件的遭遇，使得柯南感觉十分的无奈，不仅没成功获取到更多的跟组织相关的信息不说，就连组织要板仓卓开发的那个软件，自己都没时间检查就已经真的落到组织手里了——
那到底是个什么程序？
因为存有软件的光盘也设置了密码，在那么短的时间内自己根本打不开、查看不了内容，所以火急火燎的，在刚才那种情况下，自己只能出此下策。
只可惜，突然出现的琴酒打乱了自己一切的计划。
因此，组织想要找全世界的天才程序设计师最终到底目的是什么，至此随着板仓卓的死亡、实际存有程序的光盘被拿走，柯南知道自己恐怕很难再弄清楚了，除非再一次遇到组织这方面的行动……
不过，当柯南跟着阿笠博士离开车站，看着已经亮起的天色，知道组织已经撤离之后，回顾起所发生的整件事，忽然柯南就想起了当时、自己躲在柜子里的时候，琴酒对伏特加说的那句话——
“‘雪莉’那个叛徒一直在针对组织，不知道盗走了我们多少秘密？”
毫无疑问，“雪莉”就是灰原，但是……
根据琴酒的话来推测，已经逃离了组织的灰原其实一直在针对组织的行动，并且还成功盗走了组织的一些秘密……
这……
想到这，柯南神色不禁凝重了起来，回想着自从灰原出现在自己身边之后，所遇到的种种事情，好像也没有什么不对劲的事情啊，怎么琴酒会说，已经叛逃了的“雪莉”其实一直还在针对组织呢？
明明，“SONOKO”酒店那次，还有皮斯科那次，两次灰原遇到组织的人，都害怕成那个样子了……
难道说，针对组织的、是另有其人？而组织没有查出对方的真实身份，反而认定对方是叛逃出组织的“雪莉”……
还是说……
明智先生跟灰原，他们真的在自己不知道的情况下，跟组织已经暗中交锋了好几次、甚至让组织都束手无策嘛？
毕竟，要是琴酒说的是真的，那么现在还能表现的平静无事的明智先生跟灰原，可就真的耐人寻味了。
虽然自己已经猜到在组织相关的事情上，明智先生跟灰原他们对自己是有所隐瞒的，但是如果隐瞒的程度都到了这种地步的话……
想到这，柯南的神色不禁凝重，开始感觉到这样下去不行，但自己也不可能直白的质问明智先生跟灰原他们，毕竟在这次的事上，是自己首先瞒着他们的。