这些“幽影水母”似乎将联盟舰队当成了入侵领地的敌人，瞬间发动了攻击。它们的触须释放出一道道黑色的电弧，击中战舰后，竟能直接穿透部分护盾，对舰体造成破坏。
联盟舰队即刻展开反击，光子炮、量子脉冲武器齐发，然而这些常规武器对幽影水母的伤害却十分有限。关键时刻，灵幻大陆的魔法师们联手施展了一种大型的元素封印魔法，试图困住这些水母生物。星语族的心灵感应战士们则努力与它们建立心灵沟通，尝试传达联盟并无恶意的信息。经过一番苦战与艰难的沟通，幽影水母们似乎理解了联盟的来意，停止了攻击，缓缓地散开，让出了一条道路。
联盟舰队继续前行，终于抵达了幽影深空的核心区域。这里有着一座巨大的、散发着神秘光芒的结构体，像是一座由古老文明遗留下来的巨型空间站，但它的构造和运行原理却远远超出了联盟现有的认知范畴。科学家们兴奋不已，迫不及待地派遣探测机器人靠近，想要揭开它的神秘面纱。
在对这座神秘结构体进行研究的过程中，联盟的科研团队遇到了重重困难。它的表面有着一层强大的能量防护层，常规的探测手段根本无法穿透。而且结构体内部似乎有着自己独特的空间法则，进入其中的机器人常常迷失方向，甚至莫名失联。经过无数次的尝试与失败，联盟的科学家们结合了幻光圣物研究中获得的关于能量操控的知识，以及星渊晶簇对时空扭曲的原理，终于找到了突破能量防护层的方法。
进入结构体内部后，联盟发现这里布满了错综复杂的通道和各种奇异的装置。有的装置像是巨大的能量核心，源源不断地释放出暗能量波动；有的则像是信息储存库，可惜联盟一时之间还无法解读其中的内容。在不断的探索中，他们意外触发了一个古老的防御机制，一时间，结构体内部涌出了大量的机械守卫。这些守卫外形犹如古代的战甲，手持能量武器，行动敏捷且配合默契，对联盟的科研人员构成了巨大的威胁。
联盟的护卫部队迅速投入战斗，与这些机械守卫展开了激烈的交锋。星际战士们利用灵活的战术和先进的武器装备，逐渐找到了机械守卫的行动规律，开始逐个击破。而科研人员则抓紧时间，在战斗的间隙尽可能多地收集数据、研究周边的装置。经过一番苦战，联盟成功压制住了机械守卫，并且获取了一部分关于结构体运行原理以及幽影深空维度奥秘的关键信息。
凭借着这些珍贵的资料，联盟的科学家们回到联盟总部后，展开了更进一步的深入研究。经过数年的努力，他们成功研发出了基于幽影深空维度技术的“跨维航行器”，这种航行器能够突破常规的宇宙空间维度限制，实现瞬间跨越遥远距离的星际旅行，极大地拓展了联盟的活动范围和战略优势。
在军事层面，联盟利用跨维航行器的优势，重新调整了宇宙舰队的部署和战略规划。舰队可以在瞬息之间出现在潜在敌对文明的边境，形成强大的军事威慑。同时，也能更快速地响应联盟各星区出现的紧急情况，保障联盟内部的安全稳定。