在留给自家儿女、媳妇一批究极球后，林云林雨和三姐妹就赶往了究极之洞，当他们靠近究极之洞外时遇到了铺天盖地的究极异兽的攻击。而林云林雨五人也不是没准备的，他们把大部分的宝可梦直接从培育屋带了出来，现在是两军对垒，杀得昏天黑地。
而一些跑出去的究极异兽占领了樱花国，现在在到处破坏，导致现在的樱花国民不聊生。华国在见识到了究极异兽的破坏力和破坏欲后立马组织军队到樱花国支援，准备御敌于国外。
林云林雨五人在解决究极之洞外的究极异兽后就收回了大部分的宝可梦，五人开始轮流守在究极之洞外，拦截究极异兽离开。
这一守就是三年，沦为战场的樱花国政府直接亡国，他们的平民流落到周围的几个国家里。在这三年里，到樱花国参与对抗究极异兽的人和宝可梦牺牲了不少，但也铸造了不少英雄人物。
有趣的是，当初导致究极之洞出现的那三只盖诺赛克特都被华国人收服了，它们现在的主人分别是林剑心、王重和毛兴国。
特别是王重，他在得到盖诺赛克特后在樱花国战场上大放异彩，不仅仅收获了一大笔军功，拿到了许多培养宝可梦的资源。他还成功驯服了爆肌蚊和费洛美螂，成为了第一个究极异兽训练家。
而林剑心和陈思雨在对战究极异兽的时候让科斯莫姆进化成了索尔迦雷欧和露奈雅拉。林剑心还收服了垒磊石、铁火辉夜和纸御剑尝试驯服。无独有偶，林小霜也收服了恶食大王和毒贝比，就是他们收服的这五只究极异兽都不听话。
当一群人来到究极之洞前时发现林云林雨五人在处理从究极之洞跑出来的究极异兽，为首的人见林云林雨他们处理完究极异兽后立马上前嘘寒问暖，赞扬林云林雨五人的功绩。
之后就是处理究极之洞的问题，在专家一阵已经后找的了关闭究极之洞的办法，最后就是处理那一堆究极球。在高层的探讨下留下一批究极异兽，其他关着究极异兽的究极球就扔进究极之洞里让它们自生自灭。
那几只被驯服只需登记一下就行，其他的都收入国有，进行统一管理。当然林剑心和林小霜并没有把自己看上眼的究极异兽上交，而且其他人也偷偷的藏了一两只究极异兽准备尝试驯化。后来因为这批究极异兽出现了一场骚乱，但这也是后话了。
在究极之洞事件结束后，在林云林雨五人去世前各国再也没有闹出什么幺蛾子。顺便一说，究极之洞事件后华国的冠军和四大天王重新洗牌了一遍，原本的冠军被林小霜击败降为了四大天王之一，林小霜顺理成章的成为了新冠军。王重、林剑心和陈思雨打败了老牌四天王，成功上位成为了新的四大天王。
当林小霜成为冠军后，敖霜儿把她探索过的秘境资料都交给了林小霜，林云林雨五人顺便带儿女和儿媳妇去了一趟天冠山秘境，让他们和一面见了狄俄斯库里兄妹。
林云林雨骗他们狄俄斯库里兄妹是他们过去的投影，有事能来这里找他们帮忙，四人想都没想就把林云林雨的话当真了，导致林云林雨五人去世后他们五人会偶尔组团过来看望狄俄斯库里兄妹。
由于究极之洞战役消耗了林云林雨五人大量的精气神，林云林雨五人二十年后相继去世，他们在这个世界的故事到此完结。