但由于各府多是朝廷以前任用的官员来担任，若是全部施行，这些人明面上不反对，但私下必定是各种推脱，以致阻力重重。如今看来，也就只能一步步来了。
“好。”
“行动过程中切勿引起民怨，否则就有些得不偿失了。”崔世英出言提醒。
“放心，卫道心中有数。”
朝廷虽然对山东的反贼头疼不已，可依旧没有放松对农民军的围剿。明廷认为各镇抚事权责不一，应设置一名大臣统管，于是朝廷擢升陈奇瑜为兵部右侍郎兼右副都御史，总督陕西、山西、河南、湖广、四川军务。
为何明廷擢升陈奇瑜为五省总督呢？最主要的原因就是陈奇瑜巡抚延绥期间的功绩太大，极为耀眼。
于崇祯五年剿灭了一座城、薛红旗、一字王等流贼。
崇祯六年，陈奇瑜与王承恩刚率兵防御了蒙古插汉部（即察哈尔部）的进犯。
派兵剿灭义军首领截山虎、柳盗跖、金翅鹏、薛仁贵、一条龙、金刚钻、翻山鹞、黑煞神、人中虎、五阎王、马上飞等等。基本上解决了延绥地区的农民军。
陈奇瑜任职五省总督后，对战农民军连战连捷，将农民军赶进兴安的车厢峡，确实是一个合格的统帅。只不过错信了那群反复无常的农民军（诈降），以致罢官流戍，后被释放归乡。
崇祯七年五月底，卫道的探子收到了山西鼠疫的消息。卫道不敢怠慢，立马派人快马禀报刘卓。
收到消息的刘卓不敢有丝毫大意，遂令丁堇禾代自己前往各府各县调查百姓的田亩、以及生活状况。
明末的大鼠疫开始于山西，后来，随着农民军传播到了更多的地区。李自成之所以可以攻下北京城，鼠疫绝对占了极大因素，那时候的北京已经是座鬼城，守城的士兵都没有多少了。
干旱不仅导致粮食大幅度减产，也导致了多地缺水，旱、蝗、疫灾轮番上演。崇祯十一年，漕河干涸，十三年的时候，黄河甚至都干枯了，同时，江淮两河也随之冰冻。
其实，鼠疫主要是通过跳蚤叮咬、直接接触、误食感染鼠疫的动物等传播。鼠疫的防治并不难，古人已经有了一系列的防治措施。如设卡隔离疫区、掩埋尸体、药物治疗、佩戴口罩、安抚民心等。主要是明末的环境太过于恶劣，导致鼠疫传播迅速。