1. 宁锦之战（1629-1630年）
- 这场战役并非直接针对农民起义，而是明朝对抗后金（清朝前身）的重要战斗。洪承畴指挥明军成功防守住了宁远和锦州，暂时遏制了后金的攻势，但并未彻底解决边疆危机。
2. 潼关之战（1636年）
- 李自成领导的农民军突破陕西进入河南，威胁京城安全。明军在潼关设防阻止起义军东进，双方发生激烈战斗，最终明军失利，起义军得以控制黄河以南地区，局势更加严峻。
3. 松锦大战（1640-1642年）
- 此战是明朝对抗清军的重要转折点，洪承畴再次领兵作战，但由于战略失策和清军的强大攻势，明军惨遭失败，数十万大军几乎全军覆没，丧失了辽西大部分领土，极大削弱了明朝的军事实力。
4. 西安之战（1643年）
- 当时的西北已成为李自成大顺军的主要活动区域。崇祯十六年，李自成攻占西安，建立了大顺政权，宣告与明朝分庭抗礼。这场战役标志着农民起义达到了高潮，对明朝中央政府构成致命威胁。
抵御清军南侵
1. 广宁之战（1621年，发生于朱由检即位前，但影响深远）
- 广宁之战是明朝与后金早期冲突的关键战役，虽然朱由检尚未即位，但这场比赛的失败导致辽东失守，为后来的清军南侵埋下了伏笔。
2. 宁远保卫战（1626年，同样发生于朱由检即位前，但意义重大）
- 袁崇焕指挥明军在宁远成功抵御了皇太极带领的后金主力，使用火炮重创敌军，赢得了“宁远大捷”，极大地鼓舞了明朝军民的士气，延缓了后金的南进步伐。
3. 山海关之战（1644年）
- 清军趁明朝内乱之际，联合吴三桂从山海关入关，与农民军在山海关附近进行了一场决定性的会战。结果明军及吴三桂部被击败，清军占领北京，崇祯帝自尽，明朝灭亡。
这些战役不仅反映了崇祯帝时期明朝面临的严峻挑战，也体现了这位皇帝在其位期间的艰难抉择和无奈。尽管他采取了多项措施试图挽救颓势，但在内外交困的形势下，最终未能扭转乾坤，见证了明朝的覆灭。