京都府，京都市的超进化研究所分部内，一片忙碌景象。
“日本指令室的情况怎样了？速杉指导长！”出水通过通讯器问道。
速衫一边紧张地调试着设备，一边回答：“虽然我们正在全速搭建系统，但要做的事情实在太多了，根本没时间去京都观光啊！”
出水严肃地说：“敌人的出现范围正在扩大，我们必须加快步伐，挑选新的适合者将进化先锋铺向全国。”
速衫点头表示认同：“没错，如果远方或多个地方同时出现巨大怪物，以目前的状况很难应对。”
“关于这件事，我们已经开始准备了。”出水说道。
速衫眼睛一亮：“原来如此……E3……是他啊……”
而耀世那边他一边打扫卫生一边道：“喂，系统这几天的战斗奖励你好像都没有给我啊，是不是私吞了？”
（叮，宿主冤枉啊，这几天我是在进行升级，我现在就把这几天的奖励发给您）
听到这话，耀世脸上露出一丝笑容，道：“那就好。”
（叮，恭喜宿主获得奖励：分身红渡X1，血红玫瑰X1）
听到这个提示音，耀世的眼睛顿时一亮，心中暗自高兴，说道：“这奖励可以啊，这样我就不用顾不上N700kiva了。”
画面回到学校里，教室里只有隼人和山贯两个人。他们正埋头写着作业，一边抱怨着老师的决定。
"真是的~！为什么要我留下啊！" 隼人一边写着作业，一边嘴里嘟囔着。他觉得很不公平，为什么要留在这里做这些无聊的事情呢？
山贯也跟着附和道："明明我们肩负着重要的任务，却被留在这里写作业。"
"这都是因为你们考试分数太低的错吧。" 一旁的秋田突然插了一句嘴。他看着两人，脸上露出一丝无奈。
"秋田，帮帮忙啊~" 隼人转过头来，对着秋田求情道。
"我们可是住在一起的好朋友啊!"山贯也连忙点头
然而，秋田并没有被他们的话打动。他摇了摇头，坚定地说："自己的事情自己解决!谁让你们考试成绩那么差呢?"
就在这时，三人的手机同时发出了警报声，屏幕上显示着一条紧急信息："有目击漆黑新干线的消息，地点在山形新干线太泽站附近！"双叶念出了这条消息。
"山形新干线？"隼人疑惑地问道。
"嗯，看来这次任务需要我们立刻行动。"秋田说道。
"我知道了，那岂不是说，这次只能让我一个人去处理了吗？"秋田皱起眉头。
"什么意思啊？"山贯不解地问道。
"E5 和 E7 过不去。你们应该知道，福岛与山形之间的新干线铺设的是旧式铁路。如果使用全规格的 E5 和 E7，由于车辆过宽，会被卡住，不仅无法进站，甚至连通过隧道也做不到。所以，只有我的 E6 才能前往那里。"秋田详细地解释道。
"不会吧？我以前居然完全不知道这些事情。"山贯惊讶地说道。