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凯法利尼亚围攻之后 ，纳瓦罗留在冈萨洛·费尔南德斯·德·科尔多巴（Gonzalo Fernández de Córdoba）的麾下，前往那不勒斯，并在1502年防守卡诺萨（Canosa），1503年防守塔兰托（Taranto），抵御法国军队。
卡诺萨和塔兰托都属于普利亚地区。
他负责监督塞里尼奥拉战役（Battle of Cerignola）中的野战工事建设，帮助冈萨洛·费尔南德斯·德·科尔多巴在4月28日的战斗中战胜了纳穆尔公爵（Duke of Nemours）路易·德·阿马尼亚克 （Louis d'Armagnac）。
塞里尼奥拉战役于1503年4月28日在意大利普利亚地区的塞里尼奥拉镇外展开，战斗双方为西班牙军队和法国军队，距巴里约80公里（50英里）。
由“伟大的科尔多巴”（Gonzalo Fernández de Córdoba）指挥的西班牙军队约有6,300人，其中包括2,000名陆军长枪兵、1,000名火枪手和20门大炮，成功击败了由路易·德·阿马尼亚克领导的法国军队，后者人数约为9,000人，主要由重骑兵和瑞士雇佣长枪兵组成，拥有约40门大炮。
战斗中，纳穆尔公爵不幸遇难。
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纳瓦罗在1503年12月29日的加里利亚诺河战役（Battle of Garigliano）中立下大功，因而被封为奥利韦托伯爵（count of Oliveto）。
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1507年，纳瓦罗返回了西班牙，参与了红衣主教弗朗西斯科·希梅内斯·德·西斯内罗斯（Francisco Jiménez de Cisneros）的北非远征。
1508年，纳瓦罗使用自己设计的浮动炮台，夺取了韦莱斯·德·拉·戈梅拉堡（Vélez de la Gomera）。
1509年，他还参与了马扎尔基维尔（Mazalquivir / Mers-el-Kébir）和奥兰的攻占。
1510年，他亲自指挥西班牙军队征服布吉（Bougie / Béja?a）、的黎波里（Tripoli），袭击了特莱姆森（Tlemcen）、阿尔及尔（Algiers）。
正是这一年，西班牙从哈夫斯王朝夺走了北非的城市。
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