剧中大事记
1977，沟吕木真也诞生。
1982，姫矢准、西条凪诞生。
1985，孤门一辉诞生。
1989，来访者坠落在美国的沙漠地带。
1991，西条凪的母亲及其担任主任研究员的父亲被异生兽杀害于美国科罗拉多州。
针对来访者的普罗米修斯计划开始研发。
溺水的孤门为“宇宙人”所救。
1992，吉良泽优（预知者）、千树怜等优秀遗传基因之子诞生。
2004，蓝光（The One）与红光（The Next）降落在地球上。
原空中自卫队军官真木舜一与The Next合为一体并同The One在东京新宿展开交战。
The Next最终获胜。 后来，来访者将全世界人民关于The One和The Next的记忆全部消除。
被破坏的新宿地区被政府以“受巨大陨石冲击”为名将事实掩盖起来。
松永要一郎从内阁情报调查室调任至TLT－J。
松永要一郎的夫人在新宿事件中罹难。
2007，沟吕木真也离开夜袭队，并成为黑暗梅菲斯特。
2008，孤门一辉加入夜袭队。第二适能者姫矢准接受了光的力量成为奥特曼，并开始了奈克赛斯的战斗。
2009，千树怜设法来到日本，并开始在游乐园打工。
姫矢准在与沟吕木真也变身的黑暗梅菲斯特的决战中失踪。
第三适能者千树怜继承了奥特N之光。
缩水部分真相
一、奈克赛斯系列的缩水是从TV版的第25话之后开始的。所谓缩水，不仅仅是删除集数而已，而是连剧情都大大更改。原案的第25~52话的部分内容在TV版中被删改的面目全非。除此之外，剧场版奈克斯特续篇之安魂曲也没能实现。
二、在原案中，过渡集（25）后，千树怜篇（26~38）共有7只异生兽，分别是古兰特拉（26~28），班匹拉（29~30），理扎理阿苏、理扎理阿苏·谷罗拉（31~33），拜格巴尊·布鲁德（34~35），黑暗路西法（仅镜头，非正体，36），梅嘎福拉什（37~38），伽鲁贝洛斯EX（38）。在原案中，西条凪篇（39~47）共有6只异生兽，西条凪将变成奈克赛斯奥特曼未知成年形态同它们战斗。西条凪变身成为未知成年形态的是女性奥特曼。
最终西条凪将被黑暗吞噬变身为黑暗扎基并暴走（46~47）。黑暗扎基的“Zagi”则是西条凪的“凪”（Nagi）中的“N”颠倒成“Z”以后形成的。之后是在吸收了黑暗扎基的力量后的石堀光彦变成的黑暗路西法猖獗肆虐的过渡集（48~50），最终便进入孤门一辉篇（50~52）。
三、在原案中，失去记忆的沟吕木真也在被抓去TLT后便经受了痛不欲生的人体试验，他是在人体试验的刺激之下恢复记忆的。恢复记忆的沟吕木真也先找到机会强行素身越狱去找山邑理子，后被西条凪、孤门一辉、野野宫瑞生软硬兼施地劝回，关在牢狱之中。瑞生后来应该有帮沟吕木实现见理子的愿望。之后会有沟吕木真也关于西条凪、黑暗梅菲斯特等等的展现过的或未展现过的回忆的补完。当西条变成了黑暗扎基时，沟吕木在牢狱之中感知到了这件事情。像先前姬矢准逃出TLT的模式一般，沟吕木真也瞬间移动到户外并变身为光明梅菲斯特（眼灯是红色的），欲阻止并拯救西条凪却失败，被黑暗扎基重创而恢复人形。最终成功地拯救了西条的是孤门。