三伍一队，统领是队长，对应军衔是虞侯，承局；按照规划，队长亲领一伍，然后副队长再领一伍，作为战斗指挥序列的补充，如果队长战死，则副队长接替指挥；这是新增的军队指挥层级：理由有二，一是一个都头管理十伍会比较难，涉及管理幅度问题，二来也是战斗需要；三十人的正规军队，已经能处理一些协助缉捕盗贼或者守卫大帐、日常巡逻等等之类的任务了，可以算是一股不弱的战斗力量了。
三队一都，由都头统领，对应的军衔是十将，虞侯；除了三队九十人的直接战斗人员，还有附属的书记官，负责军伍文书，军功记录；直属护卫，执法队，旗手、令兵负责协助都头管理，合计百人；按照现阶段的情况，可能还需要都头兼着队长；
三都一部，由队将统领，对应的军衔是军头，十将；朝廷的队将管着五十人，是都以下的编制，梁山的队将则管着三百人。如果是独立进行战斗任务，则还需要增加管理一都的辅兵，这已经是大略可以类比朝廷一营指挥的战斗序列了。如果说都头兼队长是根据需要，队将就必然是要兼都头的，这是规定；这实际也是为了人才培养，队将做好了，就和营指挥使也差不多。
三部一营，由指挥使统领，指挥使一般不兼任队将，有营亲卫，执法兵，五蠡司马，传令兵，军医，书记等属官，合计千人。这已经是迈入校尉行列，军衔从从九品下的陪戎副尉到正八品上的宣节校尉不等，这个军衔的计算论军功，除了人头，拿下战略要地，还有就是带兵的时长，是一个综合计算的方式。千人规模的营是大型战场上的基础军阵单位，也是一般单独执行任务的单位。如驻守城墙或城寨之类，还需要统帅五百到一千不等的辅兵，对指挥使的能力有较高要求，最起码按照各位军师的意见，新上山的好汉起步最多就是营指挥使。
五营为团，由都指挥使和副都指挥使统领，都指挥使兼任营指挥使，五营包括三营标准步兵，一营骑兵，一营勤务营。其中勤务营算是亲卫，执法队，五蠡司马，传令兵，军医，书记等加强版，合计四千人，团也是将领常规长期统领的最大规模战斗序列。
三五团合为军，由都统制统领，也可以称为一般意义上的元帅，军衔就是上不封顶了。军不常设，由各团临时组成，作为方面军进行协同作战指挥，就高丽战场的战斗形式，即使两团组成军，算上辅兵，就是标准的万人大军，这种情况下，已经足够应对大部分战斗需求了。
王烨原本是打算改现在的军为“军”的，但是被杜老大，孙安，卞祥，袁朗，郝思文等人集体拒绝了，梁山这次扩军，总是不至于扩大到十万人的，一军两万人常年统领，那不是闹呢？
实际上部队的编制确定并不难，不过是军制上的细微调整，尤其是营以下的变动，从原本的营、都、伍三级结构调整成五级，也就是为了应对更多的战斗情形需要，还有人才培养。同时增加了指挥序列的稳定性，可以在营指挥使意外阵亡的时候，不至于出现战斗指挥序列的混乱。
而团和军的整改就更没什么说的，就是一个调整罢了，现在的军也就是四营编制，也就是比团稍微大一点罢了。