最终准噶尔部全军覆灭，巴图尔珲台吉和僧格全都战死，此战炎黄军全歼敌军，自身只有四千多名圣殿骑士落马阵亡。
这些圣殿骑士主要是在骑兵对冲的时候被撞落下马，还有准噶尔最后搏命一击被火枪骑兵打中造成的损失。
陈平本来想令轻骑兵和骆驼骑兵也加入战场的，可是战场空间虽大，几十万骑兵交战已经占满了整个战场，这十五万骑兵想挤都挤不进去。
待士兵将战场处理完毕，陈平令大军攻打莎车城，结果莎车城城门大开，白山派首领帕克什米带着城内守军出城投降。
陈平令十万火枪兵入城控制局面，随后在龙卫保护下进入城中王宫。
“大帅！这是巴图尔珲台吉的幼子噶尔丹，您看怎么处理？”
帕克什米领着炎黄军士兵押着一个小男孩来拜见陈平。
这就是噶尔丹？历史上令康熙派清军打了好长时间才消灭的准噶尔部首领。
“你杀了我父汗和哥哥，我要报仇！”
噶尔丹眼冒怒火，挣扎着想要摆脱士兵扑上来，陈平笑了笑，
“想报仇？可惜你没机会了！”
“来人！拖出去砍了！”
侍卫将噶尔丹拖了出去，咔嚓一刀结果了他，随后陈平看向帕克什米。
“把这个家伙也砍了！”
陈平已经知道帕克什米二次背主投敌的事情，这种人还是杀了最好，免得下次又被他背叛。
“不要啊！大帅！我可以让白山派都臣服于你，我有用啊！”
“什么这个派那个派的，炎黄军的地盘只能由炎黄军说了算，其他乱七八糟的全部都要剿灭！”
帕克什米还想再说些什么，被士兵拖到外面一刀解决。随后陈平令农民将城内伊斯兰教的教堂全部拆除。
不少信奉伊斯兰教的平民对此都产生抵触，阻止炎黄军拆除教堂的行动。
陈平下令凡是阻止炎黄军行动的全部格杀勿论，士兵们当场将闹事的几百平民斩杀，他又派出僧侣挨家挨户的劝说，看着系统地图上一个个红点逐渐转变成蓝点，陈平才安心下来。
几日后，秦升的四十万大军攻占了和田，也来到莎车城与陈平汇合。
“大帅恕罪，末将来迟，没有赶上与准噶尔部的最后一战，幸好大帅此战得胜，否则末将万死难辞其咎！”
“秦将军不必愧疚，你这一路本来就绕了很远，迟来一些时日也是正常，何况我军优势明显，不可能会输！”
既然秦升大军也到了，陈平决定将新疆全面占领，他令各将领分兵多路攻占整个新疆南部地区。
此时整个新疆都已经没有什么势力可以抗衡炎黄军，只用了一个月时间，原叶尔羌汗国的地盘和南疆地区全部被炎黄军占领。