萌萌和小动物们一起在湖边玩耍，他们分享着彼此的故事。突然，天空中飘来了一片乌云，原本晴朗的天气变得阴沉起来。小动物们开始变得惊慌失措，它们告诉萌萌，这片乌云带来的是邪恶的黑风怪。黑风怪每隔一段时间就会来破坏九寨沟的美丽，它会吹走花朵，搅浑湖水，让森林变得灰暗。
萌萌看着乌云越来越近，她决定要保护九寨沟。她想起在画册上看到过，九寨沟有神奇的力量可以对抗邪恶。于是，她和小动物们一起在森林里寻找这种力量。在寻找的过程中，他们遇到了一位白发苍苍的老奶奶。老奶奶告诉他们，在九寨沟的深处有一座水晶宫，水晶宫里有一颗七彩水晶球，只有找到水晶球，才能驱散黑风怪。
萌萌和小动物们毫不犹豫地向九寨沟的深处走去。一路上，他们遇到了许多困难，有陡峭的悬崖，有湍急的河流，还有茂密的荆棘。但是，他们没有放弃，互相帮助，克服了一个又一个难关。
终于，他们找到了水晶宫。水晶宫是一座由水晶建造而成的宫殿，在阳光下闪烁着耀眼的光芒。宫殿里有各种各样的宝石和珍珠，但是最引人注目的还是那颗放在宫殿中央的七彩水晶球。水晶球散发着强大的能量，萌萌能感觉到它的力量。
当萌萌伸手去拿水晶球时，水晶宫突然摇晃起来。原来是黑风怪发现了他们的行动，赶来阻止。黑风怪化作一股强大的黑色旋风，冲向萌萌和小动物们。萌萌紧紧地抱着水晶球，小动物们也围在她的身边。水晶球发出一道五彩光芒，光芒越来越强，与黑风怪的黑色旋风对抗着。
萌萌和小动物们齐心协力，他们心中充满了对九寨沟的热爱和保护它的决心。在光芒的照耀下，黑风怪的力量逐渐减弱，最后被彻底驱散。乌云散去，阳光重新洒在九寨沟的大地上。
九寨沟恢复了往日的美丽，花朵更加鲜艳，湖水更加清澈，森林更加生机勃勃。萌萌和小动物们欢呼起来，他们成功地保护了这片神奇的土地。
在告别时，老奶奶送给萌萌一片彩色的羽毛。这片羽毛可以让萌萌在任何时候回到九寨沟。萌萌带着美好的回忆，回到了自己的世界。她把在九寨沟的冒险经历讲给了村里的孩子们听，孩子们都被这个神奇的故事吸引，也对九寨沟充满了向往。