随着联盟与友好文明在“星宇守护”计划中的合作愈发深入，新的挑战接踵而至。超级能量的研发进入到关键阶段，每一次实验都像是在宇宙这一巨大的未知迷宫中摸索。各文明科学家们联合设计的超级能量反应堆原型在试运行时，出现了能量泄漏与不稳定的状况，泄漏的能量波动引发了周边时空的扭曲，险些造成整个实验基地所在星系的空间崩塌。
面对这一险情，联盟的应急小组迅速启动，他们操控着先进的能量稳定装置，试图压制失控的能量。而来自友好文明的技术专家们则在第一时间对反应堆的核心程序和能量传导线路进行紧急抢修。经过数小时惊心动魄的努力，终于暂时稳定住了反应堆，但这也让大家意识到，距离成功创造出安全可控的超级能量，还有很长的路要走。
在军事防御准备方面，尽管联盟特种部队与友好文明军队进行了多次联合演练，但当真正面对宇宙毁灭力量的小规模试探性攻击时，仍暴露出诸多问题。一次，一股宇宙毁灭力量的先锋能量束突袭了联盟位于银河系边缘的一个前哨站。当时驻守的部队虽然及时启动了能量护盾和防御武器系统，但由于各部队之间的协同作战出现了短暂的延迟，导致护盾在局部出现了漏洞，部分防御设施被摧毁，数名士兵受伤。这一事件让联盟及友好文明深刻认识到，在面对强大而未知的敌人时，军事指挥系统的高效性和各部队之间的无缝衔接至关重要。
于是，联盟紧急召集各友好文明的军事战略家们，共同研讨全新的军事作战体系。他们决定构建一个高度集成化、智能化的宇宙联合军事指挥网络，利用量子加密通讯技术确保信息的即时、准确传递，同时研发一套基于人工智能的战场态势分析与作战策略生成系统，以便在瞬息万变的战场上能够迅速做出最优决策。
文化领域的合作也面临着新的危机。宇宙守护主题活动虽然在一定程度上鼓舞了士气，但随着时间的推移，一些文明内部出现了不同的声音。部分民众认为，将大量资源投入到“星宇守护”计划中，已经影响到了本文明的正常生活和发展，他们对计划的长期持续性表示怀疑，甚至出现了一些小规模的抗议活动。这股文化内部的分歧浪潮如果不加以妥善处理，很可能会蔓延至整个联盟及友好文明群体，削弱大家共同守护宇宙的决心。
为了应对这一文化危机，联盟与各文明的文化使者们穿梭于各个星球之间，举办了一系列的文化交流与对话活动。他们深入到各个社区，与民众面对面地交流，详细解释“星宇守护”计划对于每个文明乃至整个宇宙的长远意义。同时，各文明的艺术家们共同创作了一部名为《宇宙命运共同体》的大型史诗剧，通过星际网络进行全球直播，以生动的艺术形式展现了宇宙面临的危机以及各个文明携手共进的必要性，重新唤起了民众内心深处的宇宙责任感和团结意识。
在探索宇宙毁灭力量的实体迹象过程中，联盟与友好文明的探索舰队遭遇了一系列神秘的宇宙现象。在深入一个被称为“暗影星云”的区域时，舰队的导航系统突然失灵，所有通讯设备受到强烈干扰，周围的空间仿佛被一种无形的力量吞噬，光线变得异常昏暗。紧接着，一些奇异的能量生物开始对舰队发起攻击。这些能量生物形如幽灵，能够在能量护盾间自由穿梭，直接入侵战舰的能源核心系统，导致多艘战舰能源瘫痪。