乾元派掌门直属机构及其人员的级别、待遇，比起各殿院都是要低一些。唯一的例外是判院，判长钱怡是长老级殿院一阶三等，位同各殿副殿主与各院院长，乃是位高权重的乾元派高层人员。
之所以如此，首先是资源的原因，各掌门直属机构及其人员有部分是掌门的私属，私人意味较浓，若级别提升会需要更多的资源，乾元派是较难负担的。
其次是为了更好的掌控，级别低处理起来就更加容易，无论是赏罚还是升降，待遇低则需要孙迪以及杨萱的“私人补贴”，虽然消耗了二人的资源，但也更加保证了他们对二人的效忠，私属性也会加强。
还有就是要考虑长老会各殿院那里，毕竟门派是公，也不光是掌门的，若是直属机构也都位高权重了，那他们是算什么，“打工仔”？那去哪干不是干，又会是什么心态？
用人用私很好理解也有其必要，但一定要有限度与分寸，不然那就自己玩了。“家庭小作坊”还可以，再大了可就玩不转了。
杨丽作为内府总管却没有参加长老会会议的资格，这也好理解，以她的身份与权势，一旦去了这会也就不好开了。在所有掌门直属机构中，只有判长钱怡一人可以参加长老会会议，这也是由判院的独特地位决定的。
如果是军议，则在掌门府第举行，以战殿为主，同时会邀集其他殿院有关人员，各掌门直属机构也会列席。
战殿也是比较特殊的殿，它只是名义上属于长老会殿院序列，实际上还是由二位掌门直接管辖，但它也不属于掌门直属机构，相关事务的处理及人员的安排还是按殿院系统那套模式进行而非是掌门直属机构那套模式。
战殿除了和其他殿一样的下属机构，还辖有战军、卫军及戍军三支军队，军总部也在战殿，不过除了战军目前的驻地在乾元派大本营，其他两军的驻地都在各理事会，而且，战军的驻地现在也搬到了原第一理事会新并入乾元派的区域，那里被称为第二直控区，原平定府及碧波府狭长地带被称为第一直控区。
乾元派的军事体制与其他势力有所不同，与蓝星也不大一样，战殿乃是两大系统，一为战殿系统，类似兵部或枢密院，一为军总部，或者称乾元军总部，下辖陆师部和海师部等，及各战区。
战殿殿主为郭小灵，而乾元军的统帅和副统帅为孙、杨二位掌门，不过目前并没有军种长官和战区长官，总体上也比较粗糙，到了战时再临时组建前线部队并任命人员，战后再各回驻地，平时则以守御为主，若遭遇袭击则再临时组建指挥部。
天墟的情况有其不同之处，只要两位掌门在，那就问题不大，但现在情况有变，若是二位掌门都不在，再这么粗糙可就不行了。
只是孙迪作为蓝星底层对这类事所知不多，且有关经验更是为零，杨萱的情况也好不到哪去，好在有各种理论的、现成的可以借鉴，手下也有懂行的，可以慢慢来。
也是因为孙迪的离开，杨丽也要跟着去，自从杨丽加入乾元派成为内府总管以来，也是兢兢业业、恪尽职守，虽然不擅长有关事务却是勤奋好学、敬业努力，终于也是成为合格的内府总管，把掌门直属机构打理的有模有样。