随着飞船的降落，超级能量源被迅速转移到联盟的核心研究室，众多顶尖科学家齐聚一堂，开始着手研究如何将这股强大而神秘的能量与联盟现有的科技体系相融合。
林宇博士作为首席科学家，带领着他的团队日夜奋战在实验室中，面对能量源复杂而独特的能量结构，他们尝试了一种又一种方案，却屡屡碰壁。
在一次关键的实验中，能量源突然释放出一股强大的能量脉冲，瞬间冲破了实验室的防护屏障，造成了大面积的设备损坏和人员伤亡。林宇博士也在这次事故中受了重伤，但他凭借着顽强的意志，在病床上依然坚持指导后续的研究工作。这次事故让联盟上下陷入了一片恐慌之中，许多人开始质疑获取能量源的决策是否正确，甚至有人主张将其销毁，以免带来更大的灾难。
然而，杰克船长和远征队的成员们坚信，超级能量源是联盟战胜神秘力量的关键，他们向联盟高层请愿，给予科学家们更多的时间和支持来攻克技术难题。在他们的坚持下，联盟高层决定暂时保留能量源，并加大对研究工作的投入，增派更多的科研力量协助林宇博士的团队。
与此同时，神秘力量并未停止对联盟的攻击。他们趁着联盟内部因能量源事故而陷入混乱之际，发动了一系列更为猛烈的突袭行动。联盟的多个边境星球遭受重创，防御工事被摧毁，大量无辜的平民流离失所。面对神秘力量的步步紧逼，联盟军队在前线苦苦支撑，损失惨重。
在这内外交困的关键时刻，林宇博士的团队终于在研究上取得了重大突破。他们发现了一种能够稳定能量源输出的方法，通过构建一个特殊的能量矩阵，可以将超级能量源的能量逐步转化为可供联盟各种武器和防御系统使用的清洁能源。但这个能量矩阵的构建需要一种极其罕见的矿物——星耀石，而这种矿物在联盟境内的储量极为稀少，且分布在环境极其恶劣的星球上。
杰克船长毫不犹豫地再次请缨，带领着一支由远征队成员和精英士兵组成的采矿队伍，踏上了寻找星耀石的艰难征程。他们所前往的星球充满了各种危险，狂暴的风暴、致命的辐射以及凶猛的外星生物，每一步都充满了生死考验。