联盟高层震怒，决定对强硬派实施经济制裁，同时加快与新兴势力的合作落地。科研基地内，联合研发的新能源护盾进入试验阶段，一经启动，光芒闪耀，能抵御高强度攻击。士兵们配备上新型能量武器，战斗力大幅跃升。
面对联盟的反制，强硬派内部也出现分裂，部分成员不满与海盗勾结的行径，开始倒向新兴势力。在又一次小规模冲突中，这部分倒戈力量关键时刻反水，协助联盟击退强硬派主力。
经此系列波折，联盟与神秘力量残部的新兴势力正式签署和平条约，双方互设交流基地，共享科技与资源。林宇博士的科研团队定期前往残部交流学习，杰克船长则负责训练双方联合舰队，提升协同作战能力。
宇宙浩渺，虽仍有未知挑战潜伏，但联盟在曲折中踏出坚实一步，向着和平繁荣的星际未来进发，每一个成员都深知，守护这来之不易的局面，需持续的智慧、勇气与团结…… 故事于此留下悬念，等待后续的星际风云再续传奇篇章。
几个月后的一天，林宇博士像往常一样带着团队前往交流基地。当他们的飞船即将抵达目的地时，突然探测到一股异常的能量波动。这股波动并非来自已知的任何一种能源形式，而且它正在快速靠近交流基地。
与此同时，杰克船长正在训练舰队，也察觉到了异样。他立刻命令舰队进入警戒状态，并率领一部分战舰前去探查。
林宇博士等人到达交流基地后，与残部的科学家紧急商讨对策。大家推测这可能是某个隐藏在宇宙深处的古老种族被之前的能量波动吸引而来。
杰克船长的舰队很快与这股神秘力量相遇，对方的战舰造型奇特，武器威力惊人。就在战斗陷入胶着之时，林宇博士通过通讯器告知杰克，他们发现这种神秘力量对某种特定频率的能量波十分敏感，可以利用这一点制造干扰。