随着研究深入，林宇博士发现量子稳定装置的关键材料，竟与瑞恩和米拉发现的生物修复技术所需的特殊微生物有着奇妙关联。两种技术相互融合，不仅解决了能源稳定性问题，还意外催生了一种全新的“生态能源护盾”。这种护盾如同有生命一般，能自我修复微小破损，抵御外敌时还能利用周围环境能量强化自身防御。
但危机接踵而至，联盟的情报人员截获了星灵族与宇宙黑市交易的关键信息，得知“星灭炮”即将完工，一场灭顶之灾近在眼前。联盟紧急召开最高会议，商讨对策。最终决定兵分两路，一路由杰克船长率领联合舰队，主动出击，深入星云寻找并摧毁“星灭炮”；另一路由艾丽带领特别行动队，潜伏至宇宙黑市，破坏星灵族的交易供应链，延缓武器制造进程。
杰克船长的舰队向着星云进发，一路上冲破星灵族设下的多重防线。进入星云后，紊乱的能量场让导航系统失效，舰队陷入混乱。关键时刻，凭借经验与果敢，杰克船长指挥战舰利用能量场的波动规律，相互配合，逐步靠近目标。然而，星灵族早有防备，“星灭炮”周围布满了强力防御工事，还有大量战斗机器人守护。
另一边，艾丽等人伪装成黑市商人，混入了交易场所。在鱼龙混杂之地，他们小心周旋，逐步摸清了物资储存仓库的位置。正当他们准备动手时，却被狡猾的黑市头目识破身份，瞬间陷入重围。瑞恩凭借敏捷反应，为队友争取到了突围机会，众人与敌人展开激烈巷战。
在星云深处，杰克船长的舰队拼尽全力，与星灵族守军展开殊死搏斗。他们利用新研发的战术，配合“生态能源护盾”，逐渐撕开了敌人的防线。最终，找到了“星灭炮”的核心控制单元，安置好爆破装置。但撤离途中，舰队遭遇星灵族援军，陷入绝境。
此时，艾丽等人成功炸毁了黑市仓库，切断了星灵族的关键物资供应，星灵族援军慌乱之际，杰克船长抓住机会，带领舰队突出重围。随着一声巨响，“星灭炮”在星云深处化为废墟，星灵族的野心再次被粉碎。
经此一役，联盟在废墟之上重建辉煌。各个星球重拾团结，资源共享、技术共研成为风尚。林宇博士的科研成果广泛应用，推动着联盟迈向科技新高峰；杰克船长的联合舰队壮大升级，守护着星际航道；艾丽和特别行动队成为传奇，激励着一代又一代年轻人投身星际事业。在那浩瀚宇宙之中，联盟宛如破晓新光，穿透阴霾，向着无尽的星辰大海，稳健前行，续写属于他们的壮丽史诗。