杰克船长舰队在困境中，工程师们争分夺秒研发“光学隐形探测仪”与“电浆中和护盾”。前者利用光量子反射原理，能探测隐形物体；后者可吸收电浆能量，保护战舰。装备初成，舰队再战。先用探测仪定位地雷与外星生物，再开启护盾推进，集中火力打击。但外星生物繁殖迅速，新一波攻击让舰队压力倍增。
林宇博士紧急向联盟求助，总部速派星图专家，结合博士发现，破解密码，开启“星力枢纽”封印。能量平衡瞬间恢复，磁场扭曲解除，周边区域趋于稳定。
艾丽特工队陷入绝境时，技术特工黑入生物识别系统，打开机房。他们植入病毒，瘫痪操控塔，反联盟阵营加密信息中断，各星球文明恢复自主意识，纷纷倒戈，协助特工队剿灭残余势力。
杰克船长舰队苦战之际，联盟援军携带大量“电浆中和护盾”赶到，联合舰队全力反击，外星生物死伤大半，残部逃离。“幽灵雷区”也被彻底清除。
经此一役，联盟转危为安。林宇博士带回星渊古老科技，开启多学科前沿研究；艾丽和特工队守护联盟思想防线，获至高荣誉；杰克船长的新战舰战术成型，为联盟打造无敌舰队奠定基础。宇宙再次恢复和平，联盟在废墟与胜利中汲取力量，向着曙光，开启新一轮探索、发展的壮丽征程，续写传奇篇章。