在激烈战斗中，“星耀号”不幸被一道能量束击中，引擎受损，摇摇欲坠。玛雅紧急迫降在一颗小行星上，队员们则陷入孤立无援的苦战。关键时刻，阿瑞灵机一动，他发现傀儡对特定频率的暗能量波动有反应，于是利用飞船上的备用能源，改装出一个简易的暗能量波发射器，调节频率后，成功吸引傀儡注意力，为队友争取到喘息之机。
趁着傀儡被引开，队员们迅速抢修“星耀号”，更换受损引擎部件，重启动力系统。重新起飞后，他们决定改变战术，先寻找堡垒的能量护盾弱点。经过一番细致探测，终于发现护盾在某一角度的能量输出较为薄弱。
玛雅驾驶飞船，佯装正面强攻，吸引堡垒火力；洛克、阿瑞和艾达则乘坐小型穿梭机，绕道至薄弱处。洛克凭借超强的身体素质，在穿梭机接近护盾时，弹射而出，手持特制破盾装置，成功附着在护盾上，启动后，护盾瞬间出现一个缺口。阿瑞和艾达趁机冲入堡垒内部，一路躲避陷阱与巡逻卫兵，寻找核心控制室。
在堡垒深处，他们发现了一个巨大的“混沌引擎”，正是它源源不断地输出混沌能量，驱动侵蚀进程。阿瑞与艾达试图破坏引擎，但遭到重重防护机制阻拦。与此同时，堡垒的防御系统察觉到内部入侵，警报大作，卫兵纷纷赶来支援。
洛克得知队友被困，心急如焚，在外面奋力抵抗卫兵，身上多处受伤。玛雅驾驶飞船，强行突破剩余防御，进入堡垒内部，与洛克会合，一同杀向核心控制室。
四人最终在控制室相聚，面对复杂精密的混沌引擎控制系统，阿瑞凭借深厚的专业知识，迅速找到关键节点，在队友的掩护下，成功植入病毒程序，瘫痪了引擎。随着引擎停止运转，堡垒的能量护盾失效，防御炮塔也陷入沉默，整个黑暗堡垒开始分崩离析。