联盟从诸界之门的危机中缓过神来，短暂的平静里，主基地星球处处是忙碌的重建景象。科研实验室中，“星语”博士带领团队废寝忘食地研究着从异次元带回的样本与数据，试图解析其中复杂的规则，将其融入联盟现有的科技体系，开发出更具颠覆性的武器与防御机制；船坞内，工程师们参考古老方舟的构造，对新型战舰进行优化升级，增强其在复杂能量环境下的适应性；“钢拳”则在星际陆战队的特训基地，制定全新的战术演练计划，模拟与各种奇异生物的对抗场景，训练士兵们的应变能力。
然而，宇宙的暗流从未停止涌动。在遥远的“死寂星云”深处，一股熟悉又陌生的强大气息悄然复苏。曾经被联盟击败的暗影族残党，在混沌的黑暗中觅得了一线生机。他们与诸界之门逸散的混沌物质融合，自身力量得到了脱胎换骨的蜕变，更解锁了古老而邪恶的禁忌法术——“星渊咒术”，能操控黑暗能量侵蚀星辰，汲取其核心力量。
首当其冲的是一颗位于联盟边境的资源丰富但防御薄弱的星球——“曙光星”。原本生机勃勃的它，在一夜之间被黑暗笼罩。天空中，巨大的暗影漩涡缓缓旋转，吞噬着光线，星球表面，地震频发，火山喷发，城市在黑暗能量的冲击下沦为废墟。居民们惊恐万分，发出绝望的求救信号。
联盟舰队迅速集结，“星刃”队长一马当先，率领先锋战舰冲向曙光星。可当他们进入星球大气层时，便遭遇了前所未有的阻碍。暗影族设下的“星渊护盾”不仅能抵挡炮火攻击，还会反弹能量，数艘战舰瞬间受损，护盾破裂，引擎失灵。“星刃”队长见状，当机立断，下令舰队分散，从不同角度佯攻，寻找护盾薄弱点，自己则驾驶着改装后的高速战机，携带新型“灵晶破魔弹”，凭借高超的飞行技巧，向着护盾核心冲去。
在地面，“钢拳”带领陆战队紧急空降。他们身着能够抵御暗影侵蚀的“星耀战甲”，艰难地在黑暗笼罩、废墟纵横的城市中穿梭。每前进一步，都要对抗暗影能量的拉扯和混沌物质带来的幻觉。但“钢拳”凭借钢铁般的意志，鼓舞着队员们，解救被困民众，同时寻找暗影能量的汇聚节点，试图从内部破坏敌人的防线。
后方主基地，“星语”博士争分夺秒地工作着。他通过监测卫星的数据反馈，发现暗影族这次进攻利用了星辰之力的共鸣原理，于是迅速调整“灵晶净化矩阵”，使其频率与受攻击星球的星辰频率同步，试图切断暗影族与星辰的连接。然而，暗影族的星渊咒术太过诡异，净化矩阵的效果大打折扣。
艾丽在商业联盟总部心急如焚，一方面紧急调配物资，支援前线；另一方面，她利用广泛的人脉，收集宇宙各地关于暗影族和星渊咒术的情报。在情报搜集中，她发现了一个惊人的线索：在古老传说中，有一种名为“星耀圣晶”的神秘宝物，深藏于宇宙初始之地，拥有净化一切黑暗、驱散星渊咒术的强大力量。