在联盟成功解决了一系列外部威胁后，内部却逐渐暴露出诸多问题，让整个联盟陷入了危机四伏的境地。曾经团结一心的各个星球势力，如今因利益分配不均、理念差异等问题，开始出现了裂痕。
在资源分配方面，一些资源丰富的星球认为自己为联盟做出了巨大贡献，却未得到相应的回报，对资源分配制度产生了强烈不满。这些星球拥有丰富的矿产、能源等资源，在联盟对外的战争中，源源不断地提供着物资支持。他们觉得自己的付出没有得到足够的重视，联盟给予的资源分配份额远远低于他们的预期。例如，有着丰富能源储备的“炎阳星”，为了满足联盟的能源需求，过度开采导致星球内部的地质结构出现不稳定，生态环境急剧恶化。然而，当他们向联盟申请更多的生态修复资源和技术支持时，却遭到了拒绝。联盟认为炎阳星已经从之前的资源交易中获得了丰厚的利益，应该自行解决生态问题。炎阳星的领袖对此感到极度愤怒，认为联盟过河拆桥，对资源分配制度的不满达到了顶点。
而那些资源相对匮乏的星球，则指责其他星球过于自私，不愿共享资源，导致联盟内部矛盾不断升级。像是“绿源星”，这是一个资源贫瘠但人口众多的星球，主要依赖外部资源的输入来维持发展。在资源分配会议上，绿源星的代表多次恳请其他星球能够给予更多的资源支持，尤其是粮食和基础建设材料。但那些资源丰富的星球却以各种理由拒绝，认为绿源星自身发展不力，不应该总是依赖外部援助。这使得绿源星的民众对其他星球充满了怨恨，联盟内部的团结气氛荡然无存。
例如，矿业星球因长期过度开采，环境恶化，急需大量资金和技术支持来进行生态修复，但其他星球却在资源分配会议上推诿责任，不愿提供帮助，使得矿业星球的代表愤然离场。矿业星球曾经是联盟的资源支柱，为联盟的建设和发展提供了源源不断的矿石和金属。然而，多年的开采让这个星球变得千疮百孔，土地荒芜，水源污染，空气充满了有害物质。矿业星球的居民健康受到严重威胁，生态系统濒临崩溃。在一次关键的联盟资源分配会议上，矿业星球的代表详细阐述了他们所面临的困境，请求联盟调拨专项资金和派遣顶尖的生态专家来帮助他们进行环境修复。但其他星球的代表却纷纷表示，自己的星球也有众多的发展需求，无法为矿业星球提供太多的帮助。有的星球甚至认为矿业星球是自作自受，应该自己承担后果。听到这些冷漠和推诿的话语，矿业星球的代表愤怒不已，当场指责其他星球的自私和无情，然后愤然离场。这一事件成为了联盟内部矛盾激化的标志性事件，让原本就紧张的资源分配问题更加尖锐。
理念上的分歧也愈发明显。以科技发展为核心的星球，主张大力投入科研，提升联盟的整体科技水平，以应对未来可能出现的更强大的敌人。“星辰之光”就是这样一个极度崇尚科技的星球，他们拥有先进的科研设施和顶尖的科学家，一直在推动联盟加大对科技研发的投入。他们认为，只有不断创新和突破，才能让联盟在宇宙中保持领先地位，抵御未知的威胁。星辰之光星球提出了一系列雄心勃勃的科技项目，包括超光速航行技术、能量护盾的强化以及人工智能的深度开发。他们坚信，这些科技的突破将为联盟带来巨大的战略优势。
然而，一些注重文化传承和社会稳定的星球，却担心过快的科技发展会冲击原有的社会秩序和文化传统，双方各执一词，互不相让，导致许多重要的决策无法顺利推进。“古风星”就是这类星球的代表，他们拥有悠久的历史和独特的文化传统，注重人与人之间的情感交流和社区的紧密联系。古风星的居民担心，过度的科技发展会导致人们过度依赖机器和技术，从而忽视了传统文化中的价值观和道德准则。他们认为，科技的进步应该与社会的人文关怀和文化传承相平衡，不能为了追求技术的突破而牺牲了人们的精神世界。当星辰之光星球提出要大规模推广人工智能来提高生产效率时，古风星坚决反对，认为这将导致大量工人失业，破坏社会的稳定结构。双方在联盟的会议上激烈辩论，互不相让，使得关于科技发展的决策一再搁置。