联盟在经历了那场与邪恶势力的大战并成功取得胜利后，并没有沉浸在喜悦之中，而是清醒地认识到，邪恶势力绝不会善罢甘休，未来的挑战依然严峻，必须抓住这个难得的战后休整时机，进一步巩固和提升自身的实力。
在科研领域，科研团队围绕着黑色圆球的研究继续深入开展工作。之前在军事基地防御战中，新型能量护盾虽然发挥了关键作用，但也暴露出了不少需要改进的地方，科研人员以此为切入点，对圆球蕴含的能量原理进行更为细致的剖析，试图找到一种更加稳定、高效且能够长时间维持高强度防御的能量转化和应用方式。
他们在实验室中搭建了各种复杂的模拟环境，从极端高温到极寒，从高强度能量冲击到复杂的电磁干扰，全方位地测试圆球能量在不同条件下的表现，记录下每一个细微的数据变化，然后通过大量的数据分析和理论推导，尝试构建新的能量护盾模型。
经过数月的艰苦钻研，科研团队终于取得了一些重要的突破。他们成功研发出了一种复合型能量护盾技术，这种护盾不再是单一的能量防护层，而是由多层不同性质、不同频率的能量交织而成。最外层的能量层能够主动吸收和分散来袭的能量攻击，将其冲击力化解并转化为护盾自身的能量补充；中层的能量层具备强大的干扰能力，不仅可以干扰敌方能量武器的锁定和射击精度，还能对一些依靠能量驱动的攻击手段，如邪恶势力之前使用的星际战机等，造成系统紊乱，使其失去作战能力；内层的能量层则是最为关键的防御核心，它采用了一种全新的能量结晶化技术，将圆球能量以一种高度稳定且致密的形式呈现，能够抵御住极其强大的直接攻击，哪怕外层和中层护盾被突破，这一层也能为目标提供最后的安全保障。
为了验证这种复合型能量护盾的实际效果，联盟在一颗废弃的小行星上建立了试验场，布置好护盾发生器后，动用了各种类型的战舰和武器对其进行模拟攻击测试。从常规的能量光束射击到大规模的能量炸弹轰炸，再到模拟邪恶势力可能使用的新型特殊武器攻击，复合型能量护盾都经受住了考验，展现出了卓越的防御性能，让在场的所有科研人员和观摩的联盟高层们都大为振奋。
在军事建设方面，联盟根据大战中暴露出的军事指挥、战舰协同以及兵力调配等方面的问题，进行了全面的军事改革。首先，建立了一套更为先进、高效的联合指挥系统，这个系统整合了联盟各个星系、各个舰队之间的通讯、情报共享以及作战指挥功能，能够让指挥官在瞬息万变的战场上实时掌握全局动态，迅速做出准确的决策，并且可以实现跨区域、跨舰队的协同作战指挥，避免了以往因信息不畅、指挥不协调而导致的作战效率低下问题。