一名间谍伪装成了一名维修基地能源系统的技术工人，通过了严格的背景审查，进入到了这个小镇上工作。他每天按时上下班，背着工具包穿梭在基地的各个能源设施之间，看似认真地进行着维修和检测工作，实际上却在利用工作之便，偷偷在一些关键的能源节点上安装微型的监控和数据采集装置，这些装置能够实时收集基地的能源消耗情况、能量护盾启动频率以及战舰出动的相关数据等重要情报，然后再将这些情报传递出去。
随着时间的推移，这些间谍们的活动逐渐开始露出了一些蛛丝马迹。联盟的情报部门在一次例行的数据分析中，发现贸易星球上的能源矿石交易数据存在一些细微的异常波动，某些时间段的交易量和价格走势与以往的规律不太相符，而且这些异常情况总是出现在那名伪装成商人的间谍所在的区域附近。
情报人员觉得事有蹊跷，便开始对这个商人进行暗中调查，他们先是观察他的日常行为，发现他虽然在生意上表现得很正常，但却对周边的军事设施和联盟人员有着超出寻常的关注度，经常会在一些无关紧要的时候出现在敏感区域附近，看似不经意地四处张望。
接着，情报人员利用先进的探测设备对他的店铺进行了秘密扫描，发现店铺内存在一些隐藏的能量信号，经过进一步分析，确定这些信号来自于一些间谍专用的通讯和探测设备。
在科研交流中心那边，安保人员也察觉到了一丝异样。那名伪装成科研新秀的间谍虽然专业知识扎实，但在一些涉及到联盟核心科研机密的问题上，总是表现得过于急切，试图追问更多细节，而且他的身份背景在经过深入调查后，发现存在一些模糊不清、难以核实的地方。
中立势力这边同样发现了问题，基地的能源管理部门在检查能源系统运行数据时，发现有一些不明来源的数据传输记录，经过排查，锁定了那名伪装成技术工人的间谍安装的监控装置，并且通过对小镇上人员活动轨迹的回溯分析，发现他的行为存在诸多可疑之处。
联盟和中立势力的情报部门迅速将这些情况进行了汇总和沟通，意识到可能已经有邪恶势力的间谍渗透进来了，当下便决定联合开展一场大规模的反间谍行动，准备将这些隐藏在暗处的“毒瘤”一一揪出来，只是这些间谍都极为狡猾，能否将他们全部抓获，彻底斩断邪恶势力的情报来源，