然而，要将这些设想转化为实际可行的技术产品并非易事，面临着诸多技术难题和实际操作中的困难。
在开发新型多元宇宙通用护盾装置时，虽然理论上已经明晰了护盾生成机制，但在人工合成特殊蛋白质以及构建稳定可控的能量场环境方面，遇到了不少技术瓶颈。人工合成蛋白质的过程需要精确控制其氨基酸序列和空间结构，任何细微的偏差都可能导致蛋白质无法正常发挥作用，而要在复杂的多元宇宙环境下维持能量场的稳定，更是需要解决能量波动、不同物理规则影响等诸多问题。
对于研制新型能源发生器，模拟生物体内的能量转换回路难度极大，需要深入理解和掌握其复杂的能量调控规律，并且要确保在不同的宇宙环境中，转换回路都能准确无误地工作，这涉及到大量的理论研究和实验验证工作，耗费了团队大量的时间和精力。
在将护盾生成机制应用于生态保护技术方面，基因改造技术在不同宇宙的生命形式上应用时，面临着伦理、生态平衡等诸多复杂问题。如何确保改造后的生命不会对原有生态系统造成不可预测的负面影响，以及如何在尊重不同宇宙生命伦理的基础上开展相关工作，都需要谨慎对待并深入思考。
面对这些难题，林宇没有丝毫退缩，他再次协调双方团队，组织跨学科的专家小组，针对每个具体问题进行专项攻关。在蛋白质合成方面，生物学家、化学家与工程师们紧密合作，运用先进的分子模拟技术和高精度的合成设备，不断优化合成工艺，提高合成精度；在能量场稳定方面，物理学家和能量技术专家联手，通过改进能量操控装置和设计新的能量缓冲机制，努力克服多元宇宙环境带来的影响；在生态保护应用涉及的伦理和生态平衡问题上，生态学家、伦理学家以及政策制定专家共同研讨，制定出一系列严格的规范和准则，确保相关工作在符合伦理道德和生态要求的前提下稳步推进。