征服者的舰队抵达赤道几内亚时，航行的历史跨越了几百年。这片位于非洲西海岸的小岛群和大陆沿岸的地区，在明朝时期虽然与中国的联系并不频繁，但却与葡萄牙、荷兰等欧洲国家有着密切的海上贸易往来。赤道几内亚的历史也因此显得错综复杂，充满了各种文化的交织和不断变化的政治形势。
赤道几内亚的历史可以追溯到远古时期，当地的原住民主要是巴班吉人、福尔人和比奥科岛上的基科人等。这些部落在大多数时间里保持着与外界的隔离，靠狩猎、捕鱼和种植为生。赤道几内亚的比奥科岛和大陆部分的吉尼亚海岸，凭借其天然的港口和丰富的资源，一直是当地人赖以生存的重要依托。特别是比奥科岛，它以丰富的渔业资源和可耕作的土地，成为了几内亚湾地区的一个重要地方。
然而，随着15世纪末葡萄牙的航海探险深入非洲沿海，赤道几内亚的历史发生了变化。葡萄牙人在这里建立了贸易站，开始与当地居民进行交流和贸易。葡萄牙的航海技术和欧洲的商品逐渐进入赤道几内亚，而当地人则以黄金、象牙和奴隶作为交换。这一时期，葡萄牙人在这一地区的影响力逐渐扩大，尽管他们并未完全占领岛屿和海岸线，但他们的商贸和外交活动为赤道几内亚的历史带来了深远的影响。
16世纪初，随着葡萄牙的势力在赤道几内亚的巩固，该地区成为了欧洲大国之间争夺的焦点。尤其是在葡萄牙与西班牙达成分治协议之后，赤道几内亚便成为了西属殖民地的一部分。葡萄牙人利用其在非洲海岸的军事和商业优势，在比奥科岛建立了一个贸易中心，他们在岛上修建了港口、仓库和军事防御工事。这些防御工事以保护葡萄牙的商船免受海盗袭击，并确保从非洲内陆的货物能顺利运输到欧洲。葡萄牙的这些举措虽然为岛屿带来了商业繁荣，但也在一定程度上加剧了与当地部落的冲突。
17世纪中期，荷兰的海上贸易帝国逐渐崛起，随着荷兰商船的进入，葡萄牙在赤道几内亚的统治面临了前所未有的挑战。荷兰人不仅在海上与葡萄牙竞争，而且还利用强大的海军力量，不断攻击葡萄牙在几内亚湾的贸易站和港口。这一时期，赤道几内亚的比奥科岛成为了荷兰与葡萄牙争霸的核心区域。荷兰海军的不断挑战让葡萄牙不得不加大军事防御，尽管如此，荷兰人仍然逐渐扩展了在该地区的影响力。
在明朝时期，尽管中国与赤道几内亚的直接联系较为有限，但中国的航海家和商人早已在印度洋及非洲东岸留下了足迹。尤其是郑和七下西洋的航程，使得中国的海上文化、技术和商品开始传播到更远的地方。郑和的船队曾到达东非的部分沿海城市，虽然未深入赤道几内亚，但郑和的航海活动为之后中国与非洲的联系奠定了某种间接的基础。中国的瓷器、丝绸和茶叶，经过阿拉伯商人的手流传到非洲大陆，也为当地商贸活动增添了新的元素。