2008年9月，三鹿奶粉由于含有三聚氰胺被调查，卫生部确认“三鹿牌婴幼儿配方奶粉”事故是一起重大的食品安全事故。含有三聚氰[qíng]胺的三鹿奶粉使得婴幼儿患“肾结石”病症，众多婴幼儿住院进行治疗，甚至多名婴幼儿因此死亡。受到奶粉影响的儿童达到3000万。
2008年12月25日，三鹿集团破产，三鹿的品牌被迫出售，三鹿奶粉业务资产被三鹿收购。三鹿奶粉事件入选2008十大卫生新闻。截至2008年12月底，中国累计免费筛查2240.1万人，累计报告患儿29.6万人，住院治疗人，已治愈出院人。
三鹿牌婴幼儿奶粉重大食品安全事故引发全社会对奶制品问题的高度关注，给广大人民群众的生命财产造成了巨大损失。三鹿品牌作为中国国家免检产品、“最具市场竞争力品牌”、“中国500个最具价值品牌之一”却含有三聚氰胺，政府的公信力受到影响。2009年，中国颁布施行食品安全法，以严防“三鹿事件”重演。
1956年2月16日，在农林局畜牧科的指导下，以靳义善为首的散居在市区、郊区的18家奶牛、奶羊饲养户共45人组织起来成立了“幸福乳业生产合作社”，这是三鹿集团的前身。
20世纪70年代，三鹿由初加工到麦乳精、奶粉的深加工，80年代，由单一品牌到开发系列配方奶粉。80年代初，三鹿率先在中国同行业成功生产出母乳化婴儿奶粉。当时城市54%、农村38%新生婴儿无母乳或母乳不足，急需母乳代用品，三鹿决策层捕捉到这一信息，争取到这个项目，于1983年生产出“母乳化婴儿奶粉”。解决了中国奶制品品种单一、附加值低的现状，打响了中国奶制品向系列、配方化、标准化、高附加值的第一炮。1986年，三鹿集团创造并推广了“奶牛下乡、牛奶进城”城乡联合模式。
20世纪90年代以来，三鹿由产品经营演进到品牌经营。从1993年以来，三鹿系列调制乳粉等23个产品新获国家免检资格，被消费者誉为中国的“奶粉大王”。
进入21世纪，三鹿由重点经营奶粉系列产品拓展到系列液体奶、乳饮料、谷物食品等多系列产品。三鹿率先应用生物工程技术生产新型婴儿奶粉。随着市场竞争的加剧，三鹿进一步加强分销网络建设，率先在县区建立代理商。三鹿不断开发出从孕妇到中老年人，不同年龄段，不同人群营养需求的系列配方奶粉四十多种，三鹿实现了“三鹿奶粉伴您一生”的市场定位，三鹿又在“我让商家发财，商家助我发展”的营销思想指导下，建立起覆盖中国的营销网络。