小智一行人与芽衣透子两人意外在野外相遇，并决定一起前往飞云市，在这途中也就是前往飞云市的天之箭桥上，众人帮助一只哥德小姐与莎丽小姐重逢。
她们这超越时间的友谊，让众人很是感动，只不过众人不知道的是，今天晚上在飞云市不远处的荒野名胜区，火箭队也开始了他们的行动。
危机正悄然接近！
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飞云市！
合众地区的最大的城市，也是核心城市，摩天大楼比比皆是，十分壮观！
而最吸引人的莫过于这里的特产——飞云冰淇淋，不仅美味，而且还拥有治愈神奇宝贝异常状态的功能。
“飞云市真的好大哦！”艾莉丝顿时惊呼起来，牙牙也是露出头来，欢呼雀跃的叫了起来。
“对了，我听说这里有非常好吃的飞云冰淇淋哦，我一定要去吃吃看！”天桐笑着提议道。
“好呀，好呀！在进行道馆之前先尝尝飞云冰淇淋吧！”接着艾莉丝疑惑的四处观望道，“奇怪，芽衣和透子跑哪里去了？”
刚进入飞云市，这两个小姑娘就跑没影了，等了一会儿，就当小智一行人准备让胡帕将她们两个找回来的时候，小智突然笑道，“她们来了！”
天桐、艾莉丝以及拉帝亚斯它们顺着小智的目光看去，果不其然就看到了，芽衣正拿着两个飞云冰淇淋向小智一行人跑来，“小智哥，快尝尝这冰淇淋。”
说着，将手上的一支冰淇淋递给了小智，这让其他人见状很是羡慕，毕竟他们也很想吃冰淇淋。
“哎呀～”
突然透子出现在了其身后，一拳就落在了芽衣的脑袋上，“你乱跑什么？刚进飞云市就向着飞云冰淇淋的店铺跑去，现在又率先溜了回来！”
“对了，这是你们的飞云冰淇淋！”透子连忙从空间背包中拿出了打包好的飞云冰淇淋，一一分发了下去。
“哦耶！太好了，是飞云冰淇淋！”艾莉丝率先欢呼了起来，毕竟她可惦记好久。
“谢谢！”天桐很有礼貌的道歉一声。
而拉帝亚斯、胡帕、皮卡丘、伊布以及牙牙也纷纷拿着一个飞云冰淇淋?了起来。
“略略略～”芽衣拉下一个眼皮，对透子吐了吐小香丁，然后就慢慢地对她的冰淇淋?了起来，很是俏皮可爱！