多尔衮的猜测在多铎从前线送回来的折子里得到了验证，多尔衮立即传召满族的王公大臣们进行商讨，众王们一致同意撤军，这段时间他们的府库都已经堆满了从前线运回来的金银财宝，家里的包衣奴才们已经成群了，打这场仗的目的他们已经达成，所以再打下去的欲望也没有了，在得到众王和大臣们的一致意见后，多尔衮随即诏令阿济格和多铎除在前线部署少量满洲部队外，其余满汉八旗着即班师回朝。
在做好决定后，满清政权显示出了他作为一个新兴政权高效的行政效率，七月初十这天，多铎就已经收到了多尔衮发来的撤军之令，他再不耽误，随即召集诸将发布撤军令，并安排好诸将行军序次和路线。此次班师回京的都是满汉八旗，绿营不在其中，多铎下令安徽、湖北、江苏绿营诸部在满汉八旗大军撤走后，回师属地，各司其职，严守防区；
多铎还在南京建立满城，并于满城内部署了一个正蓝旗甲喇一千五百人，在多铎看来这一千五百人足可以抵五万绿营兵，这是长久以来征战得出来的自信，要知道他们真满洲打明军和顺军可是能以一敌百。
被留下来的甲喇章京叫百山，曾经是豪格的戈什哈，他对多铎的这个决定很不高兴，其他人都能回北京了，唯独他们这一甲喇不能回，这不是把他们正蓝旗当后娘养的吗？
虽然很不满，但是他也不敢反对，这是多铎下达的军令，你敢反对，他就敢砍了你，他们正蓝旗受豪格失势的影响，向来在八旗内受欺负，若是被多铎借抗拒军令的由头，将自己砍了可没有人来说情。
军令既下，诸军遂按照安排进行了回师的准备，他们高兴着收拾行装、整理军备，就连往日里让人叫苦不迭的炎热高温都仿佛消失了一般。
七月十五，大军正式班师回朝，满清大军浩浩荡荡的撤回了长江淮河以北，这支庞大的军队犹如一条巨龙，蜿蜒前行，气势磅礴。