在一个被黑暗笼罩的偏远小镇，一家神秘的生物科技公司——“暗影生物科技”，正在进行着一项高度机密的生化实验。这家公司表面上致力于医药研发，实际上却在暗中探索一种能够改变人类基因的病毒，妄图以此控制世界。
年轻勇敢的记者艾丽，听闻了一些关于暗影生物科技的传闻后，决定深入调查。她趁着夜色，偷偷潜入了公司位于小镇边缘的实验基地。基地内弥漫着一股刺鼻的化学药剂味道，灯光昏暗且闪烁不定，各种奇怪的仪器发出嗡嗡的声响。
艾丽小心翼翼地在走廊里摸索前行，突然，一阵尖锐的警报声打破了寂静。紧接着，她听到了急促的脚步声和恐怖的咆哮声。艾丽惊恐地躲进了一个储物间，透过门缝向外窥视。只见一群身形扭曲、面目狰狞的生物出现在走廊里，它们的皮肤溃烂，眼睛散发着诡异的红光，嘴里长满了尖锐的獠牙。这些生物曾经都是公司的实验体，但由于病毒失控，他们变成了只知道杀戮的怪物。
艾丽知道自己必须尽快逃离这个地方，她趁着怪物们离开的间隙，从储物间溜了出来，继续寻找出口。在途中，她遇到了同样被困在基地里的研究员汤姆。汤姆告诉艾丽，这种病毒是一种新型的基因改造病毒，它能够快速侵蚀人体细胞，使感染者的身体发生变异，并且失去理智。
两人结伴而行，在基地的深处，他们发现了一个巨大的实验室。实验室里摆满了巨大的玻璃容器，里面装着各种奇形怪状的生物胚胎，还有一些已经变异的动物尸体。在实验室的中央，有一个巨大的控制台，上面闪烁着各种指示灯。汤姆意识到，这个控制台可能是控制病毒扩散的关键。
就在他们试图操作控制台时，一群怪物冲进了实验室。艾丽和汤姆与怪物们展开了殊死搏斗。汤姆拿起了一把实验用的激光枪，向怪物们射击，而艾丽则在一旁寻找着控制台的密码。在激烈的战斗中，汤姆不幸被怪物咬伤，他知道自己很快就会被病毒感染，于是他强忍着剧痛，继续为艾丽争取时间。
艾丽终于找到了控制台的密码，她成功地输入密码，启动了病毒净化程序。随着程序的启动，基地内的警报声逐渐停止，那些怪物们也开始痛苦地挣扎起来，它们的身体逐渐恢复正常，但大多数都因为病毒的侵蚀而死去。
然而，艾丽和汤姆并没有因此而放松警惕。他们知道，暗影生物科技的阴谋可能不止于此，这个世界可能还有更多的地方被这种病毒所威胁。他们决定将这里的真相公之于众，让全世界都警惕起来，防止类似的生化危机再次发生。
在离开基地后，艾丽和汤姆开始整理他们所收集到的资料，并联系了其他志同道合的朋友。他们成立了一个名为“生化危机调查联盟”的组织，专门调查和防范各种生化威胁。但他们不知道的是，暗影生物科技已经察觉到了他们的行动，一场更加残酷的追杀即将开始……