和平探索联盟虽然成功化解了外界施加的诸多阻碍，但那些暗中窥视的老牌强大势力并未就此罢休，反而变本加厉地谋划起新的手段，企图遏制联盟的发展势头。
他们开始秘密联络宇宙中的一些星际海盗团体以及那些游走在灰色地带、唯利是图的雇佣军组织，许以重金和丰厚的资源报酬，鼓动他们去骚扰和平探索联盟的贸易航线、袭击联盟旗下的小型据点。一时间，原本安宁的星际航道上危机四伏，时不时就能看到海盗们驾驶着改装得奇形怪状的星际战舰，如鬼魅般从暗处窜出，朝着联盟的运输舰队发起突然袭击。
这些海盗战舰虽然单个实力比不上联盟的正规舰队，但胜在行动灵活、战术刁钻，而且他们毫无章法的攻击方式常常让联盟舰队有些疲于应对。运输舰队中的船员们一边操控星舰躲避炮火，一边启动防御系统进行反击，星舰的护盾在海盗们猛烈的攻击下不断闪烁，能量数值急剧下降。不少运输舰在混战中遭受重创，珍贵的物资散落于茫茫宇宙之中，给联盟的资源调配和发展建设都带来了不小的影响。
而那些雇佣军组织则更为狡猾，他们会乔装成普通的星际旅行者或者遇难者，接近联盟的小型据点，等取得信任后，再找准时机发动突然袭击。据点内的联盟成员们猝不及防，尽管奋力抵抗，但由于力量悬殊，一些据点还是遭到了不同程度的破坏，人员也出现了伤亡情况。
面对这越发严峻的局势，和平探索联盟迅速召开紧急会议，商讨应对之策。会上，各文明的代表们各抒己见，有的主张集结联盟的主力舰队，主动出击，去剿灭那些海盗团体和雇佣军组织的老巢；有的则建议加强各个据点和贸易航线的防御力量，通过构建更加严密的防御体系，让敌人难以找到可乘之机。
经过一番激烈的讨论，联盟最终决定采取双管齐下的策略。一方面，由星界联盟和星语者文明牵头，抽调各文明的精锐战舰和优秀战士，组成一支战斗力强悍的特别行动舰队，专门负责追踪那些海盗团体和雇佣军组织的踪迹，找到他们的据点后，给予沉重打击。特别行动舰队的成员们都是各个文明中的精英，他们驾驶着经过特殊改装、配备了最新式星力武器的星舰，怀揣着为联盟讨回公道、守护和平的决心，踏上了清剿之路。
另一方面，联盟加大了在各个据点和贸易航线的资源投入，不仅部署了更多的防御炮台、强化了星力护盾发生器，还安排了巡逻舰队进行不间断的巡航警戒。同时，科研团队抓紧研发出了一套智能预警系统，这套系统能够实时监测周边的星力波动以及异常能量信号，一旦发现有可疑的舰船靠近，就能提前发出警报，让联盟成员们有充足的时间做好应对准备。