在“能量源研究与管理委员会”紧锣密鼓开展工作之际，艾莉丝与暗影主宰并未停下奔波的脚步，他们往来于各个文明之间，巩固着来之不易的和平秩序。然而，看似平静的宇宙却暗潮涌动，新的危机悄然降临。
一天，艾莉丝正在与一群年轻的文明使者交流宇宙发展规划，通讯器突然传来一阵急促的警报声。暗影主宰的声音从中传出：“艾莉丝，紧急情况！在我们划定的中立贸易区，出现了大规模的能量波动异常，疑似有未知势力在暗中搞鬼。”艾莉丝心头一紧，立刻中断会议，与暗影主宰会合，带领一支快速反应部队赶赴贸易区。
抵达现场后，他们看到的是一片混乱的景象。原本有序往来的贸易飞船四处逃窜，一道道诡异的能量脉冲在空间中肆虐，不时有飞船被击中，燃起熊熊大火。艾莉丝目光锐利，迅速锁定了能量波动的源头——一艘巨大的、外形奇特的黑色飞船。这艘飞船周身散发着诡异的幽光，与周围的一切格格不入。
暗影主宰皱起眉头：“这飞船的技术不属于我们已知的任何文明，他们到底想干什么？”艾莉丝冷静地分析道：“不管他们的目的是什么，我们必须先制止这场混乱，保护贸易区的安全。”说罢，她通过通讯系统向舰队下达指令：“全体注意，保持战斗队形，对那艘黑色飞船进行包围，但不要轻易发动攻击，先搞清楚他们的意图。”
就在联盟舰队逐渐形成包围圈时，黑色飞船突然发出一道强大的能量光束，直接射向艾莉丝的旗舰。艾莉丝迅速操纵飞船躲避，光束擦着旗舰的边缘飞过，强大的能量冲击让旗舰剧烈摇晃。暗影主宰见状，立刻率领几艘战舰发动反击，激光武器和导弹齐发，向着黑色飞船袭去。
黑色飞船却展现出了惊人的防御能力，它释放出一层扭曲的能量护盾，将所有攻击都挡在了外面。与此同时，飞船上伸出多个发射管，发射出一群小型的战斗飞行器，这些飞行器如蜂群般冲向联盟舰队，展开了激烈的近身缠斗。
战斗陷入了胶着状态，联盟舰队虽然在数量上占据优势，但黑色飞船及其飞行器的技术太过先进，让他们一时难以突破。艾莉丝意识到，这样下去不是办法，必须寻找对方的弱点。她一边指挥舰队进行防御，一边命令科学家们对黑色飞船的能量护盾进行分析。
经过一番紧张的研究，科学家们发现黑色飞船的能量护盾在每次抵挡攻击时，都会出现短暂的能量波动，而且这种波动的频率和飞船的动力系统似乎存在某种关联。艾莉丝心中一动，她立刻与暗影主宰沟通：“我有个计划，我们可以利用这个能量波动的间隙，集中火力攻击飞船的动力核心，也许能一举摧毁它。”
暗影主宰点头表示赞同：“好，我来吸引他们的注意力，你找准时机发动攻击。”说罢，他驾驶着战舰，向着黑色飞船冲了过去，不断释放出强大的能量攻击，成功吸引了黑色飞船和飞行器的大部分火力。