李明和泽尔指挥舰队与这些晶体生物展开了激烈的战斗。在战斗中，他们发现这些晶体生物的力量似乎会随着云团中神秘能量的变化而增强。为了找到应对的方法，他们开始仔细观察云团中能量的流动规律，试图找到这些晶体生物的弱点。
经过一番艰苦的战斗和研究，他们终于发现这些晶体生物的核心部位对某种特定频率的能量波动非常敏感。于是，李明和泽尔下令调整舰队武器的频率，集中火力攻击晶体生物的核心。在强大的火力攻击下，晶体生物纷纷被击败，舰队暂时摆脱了危机。
然而，就在他们准备继续深入探索云团时，舰队突然收到了来自宇宙联盟总部的紧急通讯。原来，之前被击退的新文明舰队并没有放弃抢夺 “宇宙之心” 和神秘物体的计划，他们经过一段时间的准备，再次对宇宙联盟发动了攻击。而且，这一次他们还带来了一种全新的武器，这种武器能够对宇宙联盟的能量护盾和防御系统造成巨大的破坏。
李明和泽尔深知情况危急，他们立刻决定率领舰队返回宇宙联盟总部支援。在返回的途中，他们不断地与宇宙联盟总部保持联系，了解战场的最新情况，并根据这些信息制定应对策略。
当舰队抵达宇宙联盟总部时，新文明的舰队已经对总部发动了猛烈的攻击。宇宙联盟的防御系统在新文明舰队的攻击下摇摇欲坠，许多星球都受到了不同程度的破坏。李明和泽尔毫不犹豫地带领舰队加入了战斗。
他们利用之前在探索过程中积累的经验和对 “宇宙之心” 力量的部分掌握，与新文明的舰队展开了激烈的对抗。在战斗中，李明发现新文明的全新武器虽然强大，但存在着一个短暂的能量充能间隙。他迅速将这个发现告知泽尔，两人决定抓住这个间隙，对新文明的舰队发动致命一击。
李明和泽尔指挥舰队集中火力，在新文明武器能量充能的间隙对其发动攻击。经过一番激烈的交火，新文明的舰队终于抵挡不住，开始出现溃败的迹象。然而，新文明的指挥官并不甘心失败，他决定孤注一掷，启动了一种隐藏的超级武器。