自成功阻止黑暗势力的阴谋，加固了封印之后，宇宙迎来了一段相对和平的时期。李明和泽尔带领舰队回到基地，受到了全宇宙人民英雄般的礼遇。他们将起源圣物妥善安置在基地的核心防护设施中，由最顶尖的科研人员和安保力量日夜守护。
基地内，科研中心的建设正如火如荼地进行着。来自各个星球的顶尖科学家们汇聚于此，他们围绕着宇宙中的各种神秘现象和力量展开深入研究。在科研人员的努力下，一些关于宇宙基础法则的研究取得了突破性进展，这为舰队武器和防御系统的升级提供了理论支持。
与此同时，舰队的升级改造工作也在稳步推进。工程师们根据新的科研成果，对战舰进行了全方位的优化。新型武器系统被研发出来，这些武器不仅具备更强大的能量输出，还能根据不同的敌人和战斗环境进行自适应调整，大大提高了攻击的灵活性和精准度。能量护盾也进行了革命性的升级，采用了一种全新的能量矩阵结构，能够更有效地抵御各种类型的能量攻击，并且具备自我修复的能力。
李明和泽尔在忙碌的工作之余，也没有忘记提升自身的能力。他们与科研人员密切合作，参与各种实验和模拟训练，不断探索如何更好地运用起源圣物的能量，以及应对未来可能出现的各种危险。
日子一天天过去，宇宙的和平似乎坚如磐石。李明和泽尔带领舰队在宇宙中定期巡逻，维护着各个星系之间的秩序。然而，这种平静并没有持续太久。
一天，李明和泽尔正在指挥中心与科研团队讨论最新的研究成果，通讯官突然匆匆走进来，脸上带着难以掩饰的紧张：“队长，又有新的神秘信号传来！这次的信号强度虽然不高，但频率极其复杂，我们的初步分析显示，它似乎来自宇宙中一个从未被探测到的区域。”
李明和泽尔对视一眼，心中涌起一股熟悉的紧迫感。他们迅速来到通讯设备前，看着屏幕上那不断跳动的信号波形，眉头紧锁。科研团队立刻投入到紧张的破解工作中，这一次，信号的加密方式比以往更加复杂，科研人员们运用了各种先进的算法和技术，却始终无法找到突破口。
时间一分一秒地过去，整个科研中心弥漫着紧张的气氛。就在大家感到绝望的时候，一位年轻的科学家提出了一个大胆的设想：“或许我们可以尝试从宇宙的量子波动层面去解析这个信号，因为量子波动是宇宙中最基本的能量形式之一，可能与这个神秘信号存在某种深层次的联系。”
科研团队迅速调整思路，按照这个设想展开研究。经过连续三天三夜的艰苦努力，他们终于成功破解了信号。