苏然进一步熟练对结构体的操控，将风暴彻底转化为打击敌人的强大武器。在他的操控下，风暴形成了一道道巨大的能量漩涡，将敌人的飞船和势力卷入其中。“暗影联盟”及其盟友在风暴的攻击下，损失惨重，飞船纷纷坠毁，人员伤亡大半。探索小队和援军则在苏然的指挥下，借助风暴的掩护，向敌人发动了全面反击。
尽管遭受重创，“暗影联盟”依然负隅顽抗。他们集中剩余的力量，对探索小队发动了最后的疯狂攻击。一些极端的成员甚至不顾自身安危，发动自杀式袭击，试图打乱探索小队的节奏。探索小队和援军紧密配合，利用神秘物质强化的武器和防御装备，一次次化解敌人的攻击。在激烈的战斗中，探索小队逐渐逼近“暗影联盟”的核心力量。
苏然亲自面对“暗影联盟”的首领，两人展开了一场惊心动魄的对决。联盟首领实力强大，掌握着多种诡异的法则之力，但苏然凭借着对神秘物质和宇宙法则的深刻理解，以及圣级六阶的强大实力，逐渐占据上风。经过一番激烈的交锋，苏然抓住敌人的破绽，发动致命一击，成功击败了联盟首领。首领的倒下，让“暗影联盟”彻底陷入了混乱。
随着“暗影联盟”的溃败，神秘星系的战斗终于落下帷幕。风暴在苏然的操控下逐渐平息，探索小队和援军开始清理战场。他们救助受伤的人员，收集敌人遗留的物资和技术资料。战后的神秘星系满目疮痍，但探索小队却收获颇丰。他们不仅成功抵御了敌人的围剿，还对神秘物质和星系的奥秘有了更深入的了解。苏然决定，在这片神秘的星系中建立一个临时基地，继续探索神秘物质的秘密，为宇宙的和平与发展奠定更坚实的基础。