宇宙迎来新生，可战争留下的创伤满目疮痍。各个星系中，破碎的星球、损毁的太空站、漂浮的残骸，无一不在诉说着战斗的惨烈。临时基地迅速转变为宇宙重建指挥中心，苏然与各方势力代表齐聚一堂，商讨重建计划与宇宙新秩序。大家一致决定，建立一个跨星系的联合管理机构，负责协调资源分配、制定共同防御策略，确保宇宙和平不再被轻易打破。
在重建过程中，科研团队发挥了关键作用。他们将战争期间研发的先进技术，如量子冲击炮技术、能量矩阵技术、神秘物质能量转化技术等，进行整理归纳，向全宇宙公开共享。不同种族、不同文明的科研人员借此机会相互交流、合作，共同探索这些技术在民用领域的应用，推动了宇宙科技的飞速发展。一时间，宇宙中涌现出各种新型能源设备、高效的星际运输工具，为重建工作注入了强大动力。
一支探索小队在宇宙深处执行资源勘探任务时，意外发现了一处古老的神秘遗迹。遗迹中散发着奇异的能量波动，似乎隐藏着巨大的秘密。苏然得知消息后，亲自带领科研人员前往调查。他们发现遗迹中的建筑风格和能量运作方式与已知的任何文明都不同，墙壁上刻满了神秘的符号和图案，像是在诉说着一段被遗忘的历史。
科研人员利用先进的图像识别技术和语言分析程序，对遗迹中的神秘符号展开解读。经过数日的努力，他们终于取得了突破，发现这些符号记录的是一种古老的宇宙文明——起源文明。传说起源文明是宇宙中最早诞生的智慧文明，拥有着超越想象的科技和力量。根据遗迹中的记载，起源文明曾经历过一场巨大的灾难，为了保存文明火种，他们将重要的知识和技术隐藏在宇宙各处的遗迹中。
随着对遗迹研究的深入，苏然等人发现起源文明留下的不仅是知识，还有一种特殊的传承方式。遗迹中存在着一种能量水晶，当拥有特殊精神力的人靠近时，水晶会释放出信息流，将起源文明的部分记忆和技术传承给接收者。苏然凭借着与黑色晶体建立的精神链接，成功激活了能量水晶，获得了起源文明关于宇宙平衡和生命进化的重要知识，这为他未来的探索之路指明了新的方向。
然而，苏然从起源文明的知识中得知，宇宙的平衡并非永恒不变。在遥远的宇宙边缘，一种名为“熵变风暴”的灾难正在悄然酝酿。熵变风暴是一种由能量失衡引发的宇宙现象，一旦爆发，将以惊人的速度吞噬周围的一切物质和能量，所到之处宇宙秩序将被彻底摧毁。如果不能及时找到应对之策，整个宇宙都将面临灭顶之灾。