在击退不明飞行物的袭击后，银河系文明联盟进入了高度戒备状态。针对“熵变场”和不明飞行物的研究工作全面加速，各文明的顶尖科研团队汇聚一堂，夜以继日地分析收集到的数据。
经过不懈努力，科研人员取得了突破性进展。他们发现“熵变场”的能量来源似乎与一种名为“虚子晶体”的物质有关。虚子晶体存在于一种特殊的量子态空间中，它能够汲取周围宇宙空间的能量，并将其转化为熵变场的能量形式。通过对不明飞行物残骸的分析，科学家们还揭示出这些飞行器采用了一种基于量子纠缠的瞬间移动技术，这解释了它们为何能够在“熵变场”中快速穿梭并发动突袭。
与此同时，联盟情报部门经过大量的侦察与线索梳理，发现一些离奇失踪事件与一个隐藏在联盟边缘地带的秘密组织有关。这个组织行事极为隐秘，其成员来自各个文明，他们似乎在暗中收集关于联盟核心科技与防御布局的情报。种种迹象表明，这个秘密组织与制造“熵变场”的神秘势力存在千丝万缕的联系。
为了揪出这个秘密组织，联盟成立了特别行动小组。小组由人类联邦政府的精英特工、具备心灵感应能力的外星种族以及擅长追踪线索的机械文明组成。他们从失踪事件的蛛丝马迹入手，沿着星际贸易路线、废弃的星球基地展开调查。经过一番艰苦的追踪，特别行动小组终于锁定了秘密组织的一处重要据点——一个位于偏远小行星带的废弃太空站。
特别行动小组悄无声息地接近太空站，利用先进的隐身技术避开了外围的警戒系统。进入太空站后，他们发现这里充满了各种先进但非法的科研设备，以及大量关于联盟机密的文件资料。在深入探索过程中，行动小组与秘密组织的守卫发生了激烈交火。这些守卫装备精良，且似乎经过特殊训练，战斗异常激烈。
在交火过程中，行动小组成功捕获了一名秘密组织成员。通过心灵感应种族的审讯，得知这个秘密组织名为“暗星会”，他们受雇于一个自称为“熵之主宰”的神秘势力。“熵之主宰”的目标是通过制造“熵变场”，扰乱银河系的秩序，进而实现对整个银河系的统治。暗星会的任务则是收集联盟情报，为“熵之主宰”的下一步行动做准备。
就在特别行动小组准备撤离时，太空站突然响起了警报声。原来，暗星会察觉到了据点的异常，派出了增援部队。特别行动小组陷入了重重包围之中，但他们凭借着卓越的战斗技巧和团队协作，突破了敌人的封锁，成功带着重要情报撤离。
然而，暗星会并未善罢甘休。他们开始对联盟的一些关键设施发动报复性攻击，包括星际能源传输枢纽、科研中心等。这些攻击虽然规模不大，但却严重影响了联盟的正常运转，引发了民众的恐慌。