联盟的科研团队争分夺秒地研发干扰秘密基地能量护盾的装置。经过日夜不停地奋战，他们利用从“熵之主宰”科技中逆向推导出来的原理，结合联盟自身的量子技术，成功制造出了“熵盾干扰器”。这台装置能够发射出特定频率的量子脉冲，扰乱护盾的能量场，使其出现短暂的薄弱环节。
与此同时，联合舰队的突击部队也在进行着高强度的针对性训练。他们模拟秘密基地内复杂的防御环境，演练各种战术，力求在突破护盾后的行动中做到万无一失。突击部队由来自不同文明的顶尖战士组成，他们各自携带独特的武器和装备，为即将到来的战斗做好了充分准备。
一切准备就绪后，联盟展开了行动。首先，侦察部队悄无声息地接近秘密基地，利用暗物质云团的掩护，成功将“熵盾干扰器”部署在最佳位置。随着干扰器启动，一道耀眼的量子脉冲射向基地的能量护盾。瞬间，护盾表面泛起一阵剧烈的波动，出现了一片明显的薄弱区域。
突击部队抓住这转瞬即逝的机会，如离弦之箭般冲向基地。他们在穿越护盾的瞬间，遭遇了基地防御系统的猛烈攻击。能量光束如雨点般袭来，突击部队凭借精湛的飞行技巧和先进的防御装备，灵活地躲避着攻击，同时不断还击，向着基地内部突进。
在基地内部，局势同样紧张。突击部队遭遇了由“熵之主宰”残余势力操控的各种先进机甲和自动化武器。这些敌人顽强抵抗，试图阻止突击部队接近“熵变重塑计划”的核心设施。但突击部队成员们毫不退缩，他们紧密配合，发挥各自的特长，逐步突破敌人的防线。
就在突击部队与敌人激战正酣时，一个意外情况发生了。基地深处突然涌出一股神秘的力量，这股力量不仅对“熵之主宰”残余势力的设备造成了破坏，还对突击部队产生了一定的影响。起初，突击部队以为这是敌人的新武器，但经过观察发现，这股力量似乎在与“熵之主宰”的科技相互对抗。
在混乱中，突击部队与这股神秘力量的源头取得了联系。原来，这是一个被困在基地内的古老文明的残余意识。这个古老文明曾经与“熵之主宰”的前身发生过一场惨烈的战争，虽最终战败，但他们在基地内留下了一道隐藏的防御机制，目的就是阻止“熵之主宰”再次启动类似“熵变重塑计划”的危险项目。