【张居正军事改革方针里“内修守备”的重点是加强北边防务，提高军事抗衡能力。
为此便相继起用在东南抗倭立大功的谭纶、戚继光、王祟古、方逢时、李成梁等着名边将，主持蓟镇、宣府、大同、山西和辽东边务。
并在积极操练兵马、提高军队战斗力的同时，大力加固增设城防，修筑明长城。
明长城不但在重点设防地段用砖石砌筑，内填泥土石块，十分坚固，而且形制结构也更趋完备合理。
戚继光于蓟镇边垣创建1300余座空心敌台，“下发火炮，外击敌贼，贼矢不能及，敌骑不敢近”。
为提高长城防御体系的整体实力，又于战略要地加修双城，乃至多道城墙，增修辽东边墙，加强对侧翼、纵深和外围间隙地带的防御。
隆庆年间，张居正虽然不是首辅，但他实际上主持了北方边务。
除了奏请任命有功之臣担任北边守将之外，针对明朝自永乐以后，军政方面主管官员都由科举出身的文人担任，而且边防军政受到由都察院派出的巡抚、巡关御史以及监军宦官的监督和制约。